雅鲁藏布江里的35种土著鱼类就是：7种裂腹鱼、8种鮡、10种鳅，3种裸鲤，还有墨脱华鲮、墨脱四须鲃、双须叶须鱼、西藏墨头鱼、拉萨裸裂尻鱼、尖裸鲤、平鳍裸吻鱼。主要鱼类如下几种，但分布不同，需要以上游、中游、下游来分鱼种。
1、巨须裂腹鱼
裂腹鱼属分布有7个种，有墨脱裂腹鱼、横口裂腹鱼、异齿裂腹鱼、唇裂腹鱼、拉萨裂腹鱼、巨须裂腹鱼、全唇裂腹鱼。分布于雅鲁藏布江上中游干流河支流。华鲮属1个种，墨脱华鲮，分布于墨脱境内深水或洄水处。叶须鱼属1个种，双须叶须鱼，分布于雅鲁藏布江中游干支流。
2、墨脱四须鲃
四须鲃属1个种，墨脱四须鲃，分布于雅鲁藏布江下游干支流。裸裂尻鱼属 1个种 ，拉萨裸裂尻鱼，分布在雅鲁藏布江中游干支流。墨头鱼属1个种，西藏墨头鱼，分布在雅鲁藏布江下游支流浅水处。尖裸鲤属为单型属，为雅鲁藏布江特有，主要分布于雅鲁藏布江中游3000-4500米江段。
裸鲤属3个种，有高原裸鲤、软刺裸鲤、兰格湖裸鲤、只见于雅鲁藏布江中上游和海拔4000米以上的内流湖泊中，以静水或缓流环境生活为主。裸吻鱼科1属1种，平鳍裸吻鱼 ，分布于雅鲁藏布江 下游支流溪流中。
3、短尾高原鳅
在雅鲁藏布江的短尾高原鳅无论种类还是数量都占第二位，共有3属10种，分别为墨脱阿波鳅、浅棕条鳅、东方高原鳅、异尾高原鳅、西藏高原鳅、短尾高原鳅、斯氏高原鳅、阿里高原鳅、细尾高原鳅、小眼高原鳅。
4、墨脱纹胸鮡
鮡科鱼类有7属8种，有墨脱纹胸鮡、细体纹胸鮡、黑斑原鮡、黄斑褶鮡、平唇鮡、扁头鮡、凿齿鮡、藏鰋。分布于海拔较低的水域，多数分布于雅鲁藏布江下游。
5、拉萨裂腹鱼
上游区域主要是横口裂腹鱼和异齿裂腹鱼；中游区域主要有拉萨裂腹鱼、巨须裂腹鱼、高原裸鲤、拉萨裸裂尻鱼、短尾高原鳅和黑斑原鮡；下游地区主要有墨脱华鲮、全唇裂腹鱼、短尾高原鳅、墨脱纹胸鮡、黑斑原鮡和藏鰋。
雅鲁藏布江能钓鱼吗？藏族人民是不吃鱼，也不钓鱼和捕鱼。雅鲁藏布江允许其他族的人钓鱼，但不是任何河段都可以垂钓。毕竟西藏人民的风俗习惯问题，一定要遵守他们的风俗习惯，不能随便乱钓。在钓鱼前最好征求一下当地人，看那个地方可以垂钓。目前已知的是很多四川人进入到雅鲁藏布江里面捕鱼。
