阿房宫深孔钻探探孔土样
事实上，该区域在建造阿房宫之前，为河流和河流边的水湿环境。
要解决阿房宫为什么在“水坑”修建，需要更多的证据。
《史记正义》引《三辅旧事》云：“始皇表河以为秦东门，表汧以为秦西门”有东西门，也就表明秦人可能有一条东西轴线。
经测量，南北向的“南山—阿房宫—嵯峨山”轴线，向西至“汧河入渭口—渭河入黄口”轴线的西端汧河入渭口约 137 千米，至东端渭河入黄口约 135.6 千米，两者几乎相等。也就是说，阿房宫处于关中平原最宽阔之处。
“表南山之巅以为阙”——秦始皇咸阳轴线示意
同时，这条东西向轴线与阿房宫将南北向轴线几乎三分！而秦人恰好以六为纪，从这些近乎巧合的数字中，我们似乎看到了秦始皇统一后进行首都咸阳布局设计的宏大理想。
因此，秦始皇之所以选择一个河流、湿地、湖泊等的水湿环境，在此地营建朝宫，是因为这是唯一的“帝国之心”。
横向东西乃关中之中，纵向南北乃近乎黄金分割之地。
到了汉朝，无论负责营建未央宫的萧何，还是汉王朝创立者的刘邦，对在长安城未央宫前殿“近在咫尺”的阿房宫，都采取“视而不见、听而不闻”的态度，丝毫不敢把未央宫前殿与阿房宫进行比较。
当然，之后的帝王也同样没有秦始皇的气魄，来“表南山之巅以为阙”，建设一座更加宏大的建筑。
刘邦在建都长安之后，其周围含阿房宫在内原属秦上林苑的庞大空间，部分延续着上林苑的功能，部分则被赏赐给百姓耕种。
70 多年后，汉武帝即位，经过长时间休养生息的汉王朝，早已摆脱了汉初“天子不能具钧驷，而将相或乘牛车”的经济窘境，各方面得到巨大发展。
于是“年轻气盛”的汉武帝在自己南郊游猎遇阻后，决定扩修上林苑，他所扩上林苑的北界，就是阿房宫。
他将阿房宫向南直至南山、东至蓝田、西起周至的庞大空间，建成了统一的上林苑。此后，阿房宫就成为宏大上林苑中一个“不起眼”的土台子，在“门禁森严”的上林苑中慢慢地自生自灭。
