鲜虫草：
新鲜采挖的虫草多是黑色带泥土的，在封存晾干之前会用药用牙刷刷干净，在这个环节中是绝对不能沾到水，以免腐烂变质。新鲜冬虫夏草的保存原则是低温、干燥，如果买的鲜虫草量不多，最好尽快吃完。如果有一定的量，可以采用以下方法：
1、新鲜虫草可存放在冰箱的冷冻格中，随吃随取2、冷冻的虫草一旦解冻，应立即吃掉。因为鲜虫草解冻后会继续呼吸生长，消耗掉养分。
3、在冰箱中保存最多存放半年时间，时间过久，则影响口感与药效。
干虫草：
1、将虫草用厚塑料袋紧密包起来，然后再套一层后塑料袋，密封保存。如果打算近期服用，则放入冰箱保鲜层中，如果不打算近期服用，则放入冰箱中冷冻保存。2、可以将冬虫夏草放密封的玻璃罐中，同时放少量花椒或丹皮，再置冰箱中冷藏，随用随取。
3、如果量大或者需要放置较长时间最好放虫草的地方放一些硅胶之类的干燥剂，因为，虫草都有些潮而且久置容易发霉、生虫。
