两大一小打一小，巴拉圭的劣势立刻突显出来。1869年1月，巴拉圭首都亚松森被三国联军攻占。此时的巴拉圭总统洛佩斯还在外率兵进行抵抗，只是已经无关大局的走向了。不过洛佩斯很有骨气，走投无路之际依然拒绝向巴西投降，被巴西士兵砍死。
这场战争给巴拉圭带来了巨大灾难。当时的巴拉圭人口不过四五十万，战后只剩下二十多万，而男性只有不到三万人。另外巴拉圭被割走了五万多平方公里的地盘，以及失去了乌拉圭河进入大西洋的权利。更致命的是，作为巴拉圭经济支柱的马黛茶产区，被阿根廷和巴西瓜分掉了。即便如此，巴拉圭依然要把大量的财富支付给巴西和阿根廷，作为战争赔款。
巴西和阿根廷并不是列强，这场战争也让他们元气大伤，当时世界上最强大的英国，趁机溜进南美洲。战后，巴拉圭引入英国这个列强，对抗巴西和阿根廷，而英国在巴拉圭进行投资，各方面都开始渗透。
巴拉圭是个内陆国，经济等领域被英国控制之后，各种问题不少。直到现在，巴拉圭受英美掣肘，都比阿根廷巴西要大得多。巴拉圭还是拉丁美洲经济最落后的国家之一，745万的人口，人均GDP约5200美元。同样是小国，濒临大西洋的乌拉圭，人口350多万，人均GDP有1.6万美元，是巴拉圭的三倍。
