2009年1月8日,仲间由纪惠搭档加濑亮主演的爱情剧《平凡奇迹》首播,她在剧中扮演美貌能*32岁白领丽人“中城加奈”。该片讲述了平凡生活中的闪光点,一对孤独的年轻男女翔太和加奈因为一次偶然事件相遇了,因为心中都带着巨大伤痕,因此相互吸引,爱上了对方。加奈和双亲以及祖母一起生活,翔太和祖父、父亲一起生活,尽管看上去都是很普通的家庭,可是各自家中却有着无法说出的秘密和辛苦,但是由于相爱,他们也看到了生活的希望。同年年末,仲间由纪惠第四次主持红白歌会。
2010年12月4日,仲间由纪惠与堺雅人、松坂庆子、西村雅彦等联合主演的剧情片《武士的家用帐》上映,仲间由纪惠饰演男主角猪山直之美丽而贤惠的妻子“猪山驹”。该片改编自矶田道史所著《武士の家计簿 「加贺藩御算用者」の幕末维新》,以幕府时代为背景,讲述了在外人看起来有些滑稽,自身却对数学拥有着非凡天赋的御用算盘武士猪山直之,通过一本借款记账本,与妻子和家人过着简朴生活的故事。
2011年1月11日,与檀丽、渡部笃郎、三浦理惠子等合作出演的悬疑剧《美丽邻居》首播,仲间由纪惠在剧中挑战坏女人角色。该剧讲述原本幸福的一家某天搬来了一位美丽的邻居,结果家庭开始受到严重破坏和威胁。新邻居沙希和家庭主妇绘里子之间,展开了各种“斗争”,引起不小的话题。
2012年7月7日,仲间由纪惠与泽村一树、志田未来、君野梦真等共同主演的喜剧《幽灵妈妈搜查线》播出,仲间由纪惠饰演开朗且乐于助人的生活安全科警察“上原蝶子”。该剧根据佐藤智一所著漫画作品改编,讲述了在意外中去世的一名警员因放心不下儿子而不能超生。变成幽灵保护在儿子身边,与儿子成为搭档解决案情的故事。
2013年1月4日,仲间由纪惠领衔主演的悬疑剧《沙希》播出,她在剧中饰演擅长用语言挑起他人内心潜伏情绪的“网滨沙希”。该剧以在2011年1月期同台播出的《美丽邻人》中登场的“沙希”(SAKI)为主人公,沙希是凭借着美貌和温柔让男人们陷入到自己的陷阱中的恶女。
2014年10月20日,与佐藤隆太、高岛礼子、木野花等共同主演的侦探剧《SAKURA~听到事件的女人~》首播,仲间由纪惠饰演拥有独特倾听力及卓越记忆力的警察“水泽樱”。该剧讲述了一个卧底警察,早中晚做着三种不同工作,从不同的人口中打探情报,与搭档一起解决事件,同时两个完全不同的人之间的距离也慢慢缩短,最终成为真正的搭档关系的故事。
2017年1月8日,由仲间由纪惠领衔主演的悬疑剧《乐园》首播,她在剧中饰演一直活在心理阴影中的撰稿人“前畑滋子”。在《乐园》中,土井崎夫妇将15岁的女儿*害,并藏在自家地板下长达16年,女主角滋子(仲间由纪惠 饰)身为撰稿人,在寻访事件的过程中认识了一位主妇。这位主妇对滋子透露自己的儿子或许有能够看到别人记忆的特殊能力,并寄给滋子一张儿子画的画。因为画中描绘的画面与土井崎家的事件过于相像,滋子半信半疑地开始了调查。没想到不久后,这位少年就因为车祸身亡,而另一边,土井崎夫妇的二女儿因为获知父母要与自己断绝关系……
婚姻方面,虽然如大家所知,仲间由纪惠和演员田中哲司结婚并育有一对双胞胎儿子,但田中哲司近年来多次被爆出偷情事件,喜欢仲间由纪惠的粉丝都为她打抱不平。