玉米种子结构主要是胚、胚乳、种皮和果皮组成，胚生根、发芽，胚乳为种子早期生长提供养分。玉米种不能生根发芽，无论是有根无芽，有芽无根，还是无根无芽，原因有两个，一是胚本身出现了问题，即种子受损；另外一个是外部的因素造成。
外部的主要原因：
温度、湿度、水份，是种子发芽的三个基本条件，三个条件不适合时容易出现发芽问题。
1、低温高湿。氧气不足，土壤透气性差，影响胚的正常分化，出现有根无芽或有芽无根，春播早播及黏土播种容易出现这种情况。种子发芽分物理吸水、生理活化、胚萌芽（肉眼可见）三阶段，土壤水份含量60%-70%时比较理想，种子吸水占干重的48-50%时开始萌芽。当墒情不好，种子吸水不够时，无法萌芽；当土壤水份超过80%时容易烂种。
2、种衣剂，种衣剂药量过大，抑制种子发芽。
3、播种及管理的问题。
化肥烧苗（种肥距离过近，没超过7cm）、除草剂药害（药量过大、沙土渗漏、打药后下大雨等）、播种过深（7-10cm深，种子缺氧）
5、地下害虫。
内部的因素
1、种子受过冻害，种子收获时水份过大，受冻害后胚根或胚芽受损
2、种子机械损害，脱粒或加工过程中，受到机械损伤。
3、种子储存过程中被虫咬，损害胚根或胚芽。
4、种子存放时间过长，或者存储条件不理想，造成种子活力减弱。
如何解决
1、播种前晒一晒种子，激发种子活力。
2、二次包衣注意种衣剂用量。
3、播种时注意墒情和播种深度；人工点播时注意种子和底肥的距离。
4、无论出现哪种缺苗情况，怎么处理，要具体分析，如果苗缺10%，不用处理；缺20-40%时，及时补种可以减少损失；缺苗50%以上时，需要选择生育期短点的品种重播。
