1、不可与桃树混栽
在同样田间管理的前提下，正常来说，桃树的生长速度、生长量、挂果速度都比苹果高出很多，而且桃树与苹果树的水肥需求不同，在水肥需求量桃树也比苹果树要大很多。把两者一起混种，不仅在管理上比较麻烦，更主要的是桃树会长期大量抢夺土壤中的水肥养分，致使苹果长期因为营养不足影响而生长发育受抑，造成苹果树叶片黄、树势弱、产量少、果实品质差等问题，特别是在桃树生长旺期时，很容易使苹果树形成“小老树”。
2、不可与梨树混栽
梨树是苹果锈果病的病害菌寄生体，虽然锈果病菌原体会长期寄生在梨树上不会发病，但是它可以借助土壤中的根系把病害菌传染给苹果树，不但使苹果树发生锈果病、降低果实的品质，而且还会使苹果树终生带病害菌，无法根治。
3、不可与核桃树混栽
由于核桃树会产生抑制苹果树生长发育的酚类物质，对苹果的生长发育十分不利，因此二者不适合一起混种。
4、不可与樱桃树混栽
在成熟期上，苹果成熟晚，樱桃成熟较早，苹果打药会影响樱桃生长发育造成不利影响。而且樱桃上的小食心虫等害虫，不但会危害樱桃的新枝稍，后期还会蛀食苹果的果实。
5、苹果园不宜间作苜蓿、芹菜、水草、胡麻、小麦、马铃薯、蓖麻、棉花，西红柿等作物，因为这些作物与果树争水肥，病虫害严重，影响果树健壮生长，造成减产。
苜蓿、芹菜、水草、胡麻
苹果园行间种植苜蓿、芹菜、水草、胡麻，它与苹果发生拮抗作用，与果树争水肥，使害虫和啮齿动物孳生和蔓延。苜蓿根分泌物还抑制果树生长，所以不宜间作这四种作物。
小麦、马铃薯、蓖麻
小麦、马铃薯，蓖麻是苹果红蜘蛛的寄主，红蜘蛛转移到苹果树上吸食叶片汁液，造成果树落叶、落果
棉花、西红柿
棉花、西红柿与苹果树间作,棉铃虫严重。
