基德和哀在剧场版首次出现，围绕着罗马诺夫王朝的“记忆彩蛋”展开的故事。
4【瞳孔中的暗*者】2000
兰看到*人凶手 失忆忘记所有人，凶手穷追不舍，柯南拼死相救，帮兰找回记忆，新兰依旧很甜。
5【通往天国的倒计时】2001
黑衣组织剧场版出现，有关哀的过去，最后大楼爆炸逃生紧张刺激，还有少年侦探团的可爱友情。
6【贝克街的亡灵】2002
天才少年弘树，是多少人的意难平。这部采用了模拟场景游戏概念，柯南一行来到了十九世纪末世伦敦，寻找开膛手杰克。新一父亲工藤优作也在本次剧场版中登场。
7【迷宫的十字路口】2003
