清代咸丰六年（公元1856年）寺院重修，民国三十一年（公元1942年）二次重修。寺院自始建以来，规模不断扩大，成为当时胶东地区规模最大的寺庙。每年正月十五、三月三、九月九等传统节日，来此拜佛的香客络绎不绝。各地前来赶庙会的人多则达几万人，影响力也逐年加深。
文革期间，全国掀起了“深山办学”热潮，珠山中学在大庵山建校，白云寺彻底遭到破坏，致使古寺仅存遗址。 2006年12月28日在原址上重建，更名灵珠山菩提寺。于2009年9月28日隆重举行了寺院落成、开光大典暨明哲方丈升座庆典法会。
现在山东•青岛•灵珠山菩提寺占地82亩，坐北朝南略偏西，分三个区。
