不过，清朝的甘肃管辖范围依然比现在大。当时新疆的北部、东部都设置了府州县，在行政上隶属于甘肃省，而在军事上归属于伊犁将军府管辖。现在的青海西宁、宁夏也是甘肃的管辖范围。另外，清代在建甘肃省的时候，考虑到甘肃地方太过于贫瘠，就将渭河流域上游的天水等地划给了甘肃，使得甘肃的经济有所起色。
到了近代，西北发生了大规模的内乱，人口死亡了2000多万，甘肃经济又遭到了严重的破坏。左宗棠、刘锦棠收复新疆后，清朝在新疆设省，从此甘肃不再管辖新疆北部的新政事务。到了民国初期，一度将阿拉善划给了甘肃，使得甘肃看起来非常“丰满”。
民国初期的甘肃
民国后期，又将西宁划给青海，作为青海的首府，甘肃正式失去了河湟谷地。1928年，民国将宁夏一带划出来，和阿拉善高原一起建立了宁夏省，从此宁夏就从甘肃脱离而出，甘肃又失去了一块膏腴之地。
1947年的区划
经过这一系列的变动，甘肃最终变成了现在的样子。如今的甘肃省只剩下了河西走廊和渭河、泾河上游的一部分土地，地跨两个不完整的地理单。天水、庆阳一带，在地理上属于关中地区，经济、文化上受到陕西的影响更大，这就加大了甘肃的经济整合难度。甘肃和宁夏分立，又加大了黄河谷地的串联难度。
