影片的背影是在宠物小精灵的世界，每个人都有一只宝可梦，本片的主人公是蒂姆·古德曼，他却无法收服属于自己的宝可梦，确切的说是没有一只宝可梦愿意成为他的伙伴。他从小跟着母亲和外婆长大，父亲从事比较繁忙的工作与其不在一个城市，他母亲生了重病，让21岁的蒂姆·古德曼与父亲一起生活，但是他却不愿意，他与父亲接触的比较少，从而比较生疏。他是一名保险评估师，是一份无聊的工作，他想他会这么平淡的度过自己的一生。但一通电话打断了他的生活，他的父亲发生意外去世了。于是他来到了父亲工作的城市，收拾父亲的遗物，遇到了在莱姆市最大的新闻网络实习的记者露西·斯蒂文斯，在她口中得知自己的父亲正在调查一件大事，他并不相信。在打扫父亲房间时却意外与父亲的之前的宝可梦搭档大侦探皮卡丘相遇，并惊讶地发现自己是唯一能听懂皮卡丘说话的人类，比卡丘告诉他，他的父亲没有死，于是他们决定组队踏上寻找父亲并揭开真相的刺激冒险之路。探案过程中他们得到了美女记者露西·斯蒂文斯的帮助并邂逅了各式各样的宝可梦，并意外发现了一个足以毁灭整个宝可梦宇宙的惊天阴谋。
他与露西·斯蒂文斯以及比卡丘等人发现他的父亲为了阻止阴谋与比卡丘一起把超梦放了出来，但是却被霍华德·克利福德发现了，于是霍华德·克利福德派出了忍者蛙制造了车祸，并欺骗了蒂姆·古德曼，说这一切是比卡丘背叛了他的父亲，放出了超梦，超梦*了他的父亲。
