在台湾政坛，陈明通被称为“两岸通”，身为民进党党员，他在陈水扁担任台北市长期间被延揽为市政顾问，1999年陈水扁竞选台湾地区*时提出的“大陆政策白皮书”即由陈明通主笔。在陈水扁第个一任期内，陈明通被借调担任台陆委会副主委，当时的主委正是蔡英文。
2007年4月12日至2008年5月19日，陈明通又被借调担任台陆委会第八任主委。2008年岛内政党轮替后，陈明通返回台湾大学任教。2018再度回锅，陈明通也成为岛内两次担任陆委会主委职务的第一人。
陈明通自称1991年第一次到大陆，28年里走遍大江南北，亲眼看到了大陆翻天覆地的变化。
对于他的走马上任，有台湾媒体认为，他是可以在缓和两岸关系方面做一些事、对大陆释出善意的。然而，陈明通很快就暴露了真面目，开始采取一系列措施、变本加厉限缩两岸人员往来与交流。
2018年9月1日，大陆正式开放办理台湾居民居住证，台陆委会从大陆宣布这一消息起就不断横加指责，同时也不断恐吓有意办证的台湾民众。陆委会还积极推动修订“两岸人民关系条例”，限制领证台湾民众在岛内的各种权利。
2019年1月3日，陈明通罕见地亲自召开记者会，歪曲“九二共识”的内涵，妄称“九二无共识”。
2019年1月23日，陈明通到高雄拜会高雄市长韩国瑜，声称要取得民进党当局和高雄市的“战略协同”，但韩国瑜明确表示，拒绝民进党当局为高雄市设置框架。
韩国瑜率团前往香港、澳门、深圳、厦门等地拼经济，取得阶段性丰硕成果时，民进党当局上下却不断对他口诛笔伐，其中，陈明通更充当了“打韩急先锋”的角色。
2019年3月26日，台陆委会发表声明，称正研议修订“香港澳门关系条例”，对岛内县市长和政务人员赴港澳参访的申请流程和行为做出规范。随后，陈明通在接受广播节目专访时，冒出了一通“猪狗禽兽说”，引爆舆论。
“猪狗禽兽说”
台媒报道，陈明接受岛内广播节目采访，谈及韩国瑜赴港澳深厦拼经济，他称，有人为了一己之私，享受大陆给的优惠。人如果只求吃饱，那和“猪狗禽兽”有什么差别。
