而以现有技术，仍无法建成能抵御16级以上台风侵袭的跨海大桥。若是跨海大桥碰上了威马逊，损毁程度不得而知。
而琼州海峡的的海流强、海浪高，对工程实施也增加了不少困难。
以上三大自然因素（地震带、断裂带、气象条件差） 导致琼州海峡修建跨海大桥技术难度大、风险极高。
著名的港珠澳大桥平均水深37米左右，而琼州海峡平均水深达到了44米，最深处114米，加上地质条件极其复杂，在琼州海峡建跨海大桥，技术难度远远高于港珠澳大桥。
除了以上因素，还有一个最关键的原因，琼州海峡修建跨海大桥投资巨大，钱从哪儿来？广东省会愿意出这笔钱吗？海南省又出得起这笔钱吗？全靠国家掏钱也不太现实。
产生的经济效益又有多大？其实，任何一个工程建设都是追求效益的，琼州海峡修建跨海大桥不管是经济效益、环保效益，还是社会效益，都需要多方面综合考虑。从目前情况来看，飞机和轮渡尚且还能满足需求。
跨海大桥难实现，修海底隧道行不行？前面提到，琼州海峡地处地震带、断裂带，地质活动频繁，修海底隧道难度远远大于跨海大桥，我国在桥梁建设方面独树一帜，但在海底隧道方面，技术条件并不成熟，建设需求也没那么迫切，时至今日，该工程一直搁置着。
