这一时期深圳的摩天大楼也创造了新的高度，1992年12月28日，平安银行大厦，也就是曾经的深圳发展银行大厦开工，楼高183.8米，成为当时深圳第一高楼。
不过平安银行大厦的位子没有坐热，到1997年1月18日正式投入使用时，已经被前一年建成的信兴广场反超。
1993年，位于罗湖区深南东路5002号的信兴广场开工，大楼共69层，高383.95米，于1996年完工。信兴广场堪称深圳市的标志性建筑，1992年，深圳公开拍卖土地，香港信兴集团以1.4亿美元的价格中标，创下当时深圳地价的最高记录，信兴广场由此也被称为地王大厦。2017年9月，信兴广场被列入首批深圳市历史建筑。
信兴广场作为深圳第一高楼时间长达15年，一直到2011年才被441.8米的京基100超越。
同样是在1993年，罗湖区深南东路2001号的鸿昌广场开工2004年竣工，楼高218米，超过平安银行大厦，因此在地王大厦竣工之前的一段时间，鸿昌广场也曾被认为是深圳第一高楼。
经历了1993年的火爆之后，1994年深圳摩天大楼建设有所降温，这一年10月份，由彭年实业公司投资的深圳彭年广场开工，投资额近20亿元，高度248米，是彭年实业公司在深圳开发的最高大楼，1999年竣工，彭年广场位于罗湖区嘉宾路2002号。
而在1996年，又一个颇具影响力的摩天大楼动工，这就是位于福田区华强北路1002号的赛格广场，原来楼高355.8米，1999年竣工。
赛格广场是曾经福田区第一高楼、仅次于地王大厦的深圳第二高楼，也是深南大道的地标建筑，更是华强北电子街的形象代表。
据说赛格广场建成后不久就发生过晃动，随后在2021年5月份再次发生晃动，因此顶部的杆体被拆除，高度也从355.8米降到291.6米。
1990年代的最后几年，深圳的200 摩天大楼数量稳步增加，1998年，福田区深南大道6008号的深圳特区报业大厦竣工，楼高260米。1999年，福田区深南大道7088号的招商银行大厦开工，楼高249米，于2001年竣工。
（3）2000－2009年：罗湖商务中心和邮电信息枢纽大厦双峰并立，京基100一枝独秀。
这十年是深圳稳定全国地位的十年，深圳GDP从2000亿增加到8000亿，增长了4倍，2004年突破4000亿，2009年突破8000亿，而在2003年，深圳GDP首次跻身前四，北上广深的排名格局开始形成。
