现代海雀
鸟类的这四个谱系的进化，是物种趋同进化的一个经典例子，即互不关联的种群因处于相似环境中而逐步适应并形成表面上的相似结构的进化。从陆地向海洋进军的鸟类的每个种群，都以相同的方式解决了水下移动的问题：进化出更适应水下生活的双翼驱动划水的潜水方式。各个不同种群的鸟类在从陆地走向海洋的过程中之所以会产生这种趋同进化的现象，是因为鸟类的翅膀本来就都适应于在气流中飞行，而在趋同进化过程中，它们也都渐渐适应了在另一种流体——海水中的“飞行”，所不同的是，海水密度几乎是空气密度的800倍。
雄霸陆地的巨鸟
在如今的地球上，狮子和狼等食肉哺乳动物扮演着大多数陆地生态系统中食物链顶端的掠食者的角色。然而在新生代时期，一种不会飞的捕食鸟类却成为了南美洲陆地上的哺乳动物的恐怖梦魇。这种学名为Phorusrhacids的远古鸟类一般被叫作恐鸟，
它们是一个庞大的种群，这种不能飞的陆地鸟类是在陆地恐龙灭绝之后不久出现的。在某种程度上，恐鸟代表了进化历史的一种重演。像它们白垩纪的恐龙前辈们一样，它们是一种长有巨大脑袋、双足行走、卵生的恐怖“*手”——锋利的牙齿，代替了翅膀的前臂，以及多骨的尾巴，它们简直就像小型版本的霸王龙。
迄今为止发现的最大的恐鸟颅骨长达70厘米，这个巨大的头骨属于一种巨大的学名为Kelenken guillermoi的恐鸟，生活在约1500万年前的中新世中期。恐鸟幸存到今天的近亲物种是两个种类的叫鹤，这两种食肉鸟类的高度只有90厘米左右，但它们以锋利的爪子和喙，成为啮齿动物和一些小型爬行动物眼中的最怕。
史前时期最后的奇迹是巨大的学名为Pelagornithidae的“伪齿”史前古鸟，
这些鸟类一直幸存到上新世，大约在300万年前才消失。人类是在大约240万年前才开始出现在非洲的，所以我们最早的直系祖先也与这些翱翔天空的巨大鸟类失之交臂。
这些巨鸟的翼展接近6米，比如今的信天翁和秃鹰要大得多。在所有七大洲都发现了这种巨鸟和它们的近亲的化石骨骼，说明这些鸟类擅长于长途飞翔，以它们快速滑翔飞行的能力穿越世界各大洋，最终抵达了世界各地。这些巨鸟的奇异特性之一是它们的下巴上长满了像牙齿样的骨质突起——伪齿。与真正釉质的牙齿不同，这些伪齿实际上只是颅骨骨骼的增生物。
鸟岛的悲剧
纵观人类历史，无论人类新迁移到世界哪个地方，对于当地特有的鸟类的生存都构成了巨大的威胁。生活在世界各地岛屿上的500多种鸟类的灭绝，都与人类迁移活动密切相关。例如，新西兰的恐鸟因人类大肆猎*作为食物而直接导致灭绝，还有许多鸟类则因人类活动的间接影响导致灭绝，如外来捕食物种的引入、燃烧林地导致鸟类栖息地被破坏，等等。
在世界许多岛屿的已消失鸟类名单上，包括了在地球历史上曾出现过的最大的陆地鸟类。例如，生活在马达加斯加岛上的一种不会飞的巨大的隆鸟，它们的高度可达到大约3米。又如，生活在新西兰岛上的十几种恐鸟，有许多都是体形庞大的巨鸟。已消失的珍奇鸟类还包括：夏威夷的一种不会飞的、夜间活动的、通过气味寻觅食物的鸭嘴兽；渡渡鸟和它的近亲；于1972年相继消失的好几种陆生新西兰鹪鹩。
鹪鹩
尽管物种灭绝是自然进化的一部分，但近代的一些鸟类灭绝事件却并不仅仅是自然的原因。白垩纪灭绝事件虽然消灭了一些鸟类种群，但同时也为另外一些鸟类种群的崛起创造了机会。而今天我们看到的是，鸟类生物多样性渐渐消失，取而代之的却是同源的入侵物种，它们降低了岛屿生态系统的自然恢复能力。
一些人可能会认为，像渡渡鸟这样的鸟类因为它们不会飞、行动缓慢或不能适应环境，所以注定会灭绝。然而，这是一种危险的误解。这些物种之所以灭绝，不是由于它们本身的一些缺陷，而是因为环境变化太快，让它们无法迅速适应。例如，岛屿上本来没有哺乳动物的威胁，在地面筑巢的鸟类可以躲避像老鹰那样的空中掠食者，但当如猫这样的陆地食肉动物被人类带到岛上放养繁殖起来后，原本对鸟类有利的生态环境就变得危险起来了。
