吃剩下的蓝莓种子放在清水中漂洗，去掉浮在水面的瘪粒和残留在种子上的果肉，蓝莓种子一旦离开果实就会进入休眠状态，所以要低温春化。用湿布袋把种子装好放在0至4度冰箱冷藏，可以把布袋装在塑料盒子里保湿。30天左右从冰箱取出来，在太阳下晒一天即可催芽。
蓝莓的育苗一般都是在春季，最佳育苗时间是2月至4月。到了育苗的时期，将种子用赤霉素（九二0）溶液浸泡，打破它的休眠。赤霉素先用酒精溶解后倒入水中，浓度为400mg/L，即一公斤水放入0.4克赤霉素，浸泡12个小时。
蓝莓种子不能直接在土壤中播种，需要播种在特殊的基质中。基质的准备：播种前，到河湖沟渠里采集一些新鲜湿润的苔藓，将苔藓清洗干净后铺在提前准备好的容器底部，然后将种子均匀地撒在苔藓上，可以带一些浸泡的赤霉素液。用保鲜膜覆盖保湿，在保鲜膜上用牙签扎一些小孔来透气。放置在15-25度的环境中，平时多观察喷水保持湿润。一般经过40天左右，种子就会露白发芽，种子发芽后需要继续在苔藓基质容器中生长一段时间。
当幼苗生长到8厘米左右，生出2片真叶时，就可以移出苔藓基质容器了，移植到育苗盆中。
准备直径30厘米左右的育苗盆，装入培养基质，基质要富含有机质、酸碱度为5.5左右的偏酸性为佳。
将花盆装满基质土壤，用铲子在中间挖出10厘米左右的小坑，然后将蓝莓幼苗从苔藓容器取出，移植到花盆的坑里，再用基质封坑压实，最后浇上足量的水，放在阴凉处，10天后可以见阳光，但夏天注意遮阳防晒，等到植株长大后可根据具体情况移栽到大田。
