安装造价高
毛细管辐射空调一般采用空气能热泵两联供设备作为主机设备，可以通过墙面和顶面走冷水达到制冷效果，通过地面走热水达到制热效果，根据冷热量的需求也可以同时循环冷水和热水，对于独立使用空调和地暖设备而言，造价会更高，每平方米的造价普遍在一千元左右，甚至更高。
毛细管辐射空调有着舒适度高、噪音低、洁净度高、能耗低、恒温性好、美观不占室内空间以及安装灵活等优点，但是缺点也很显著对保温要求高、系统设计难度高、对水质要求高以及安装造价高。就目前的建筑而言，想要做到很好的恒温和恒湿效果相当困难，首先要面临的问题是建筑的保温性能和环境湿度影响，这两方面因素容易导致毛细管制冷时结露，进而导致室内的装饰面潮湿发霉，而对于保温和除湿的投入会非常大，这也是毛细管大面积普及需要克服的最大障碍。
