先将豆子浸泡两三个小时，等它变得饱满圆润即可。然后放到锅中煮熟，煮到豆子一捏就烂为止。最后连水一起倒进塑料瓶中密封进行发酵，放在温暖的地方一两个月就能完成了。
制作的过程虽然很简单，但是还是有许多需要注意的地方。比如发酵的时间，一般情况下，温度偏高的时候发酵时间会加快。因此夏季20天就行了，而冬天要两三个月，直到豆子腐烂变色为止。
还有发酵的时候水装得不能太多，因为发酵时会产生许多的气体，如果没有足够的空间会容易让瓶子爆裂。如果觉得有点臭味的话，可以在里面加点新鲜的果皮，味道会缓和很多。最后稀释的时候一定要调好比例，尽量避免烧根。
一般来说，所有的植物都能使用黄豆肥，但是它里面的的氮肥比较多，因此最适合在生长枝叶的时候使用。如果是临近开花的植物最好少用一点，不然很可能会影响到开花。而且使用的时候要注意，只取用上面澄清的液体部分，下面的残渣是不需要的，使用之前还要兑入10倍的清水才可以浇花。
