然而随着清军不断向南推进，水土不服的问题开始出现，该地区终年闷热多雨，气候潮湿，烟雾缭绕，瘴气严重，自然环境十分恶劣。
再加上缅军倚仗复杂地形，设立木寨、水寨，据险坚抗，严重拖延了清军进攻的步伐，清军这边，尤其是久居北方的满洲兵，身体很不适应。
官兵染上瘴气热带疾病纷纷病倒，有的甚至一命呜呼，从总兵、都统到提督等一票高级将领均被恶性传染病夺去生命。
清军原有的水陆军三万一千余人死亡过半，遭受重创，傅恒也未能幸免，感染后腹泻一天比一天厉害，最终一病不起。
乾隆在得到傅恒病倒的消息后大惊失色，也不顾天朝上国的颜面，立即令傅恒班师回京。
恰巧缅甸国王也因力竭，有罢兵乞和之意，乾隆正好借机下了台阶，同意清军与缅方议和。
1770年二月，傅恒回朝，不过他的病情却进一步恶化，五个月后就病逝了，享年仅四十八岁。
悲痛之余的乾隆亲登其府在灵前祭酒，并要求按宗室镇国公规格办理葬礼，赐谥号“文忠”。1796年赠郡王衔，并配享太庙。
