1、主要文学作品集：
《忧郁的田园》、《暮色笼罩下的祠堂》、《红葫芦》、《蔷薇谷》、《少年》、《大水》、《追随永恒》、《三角地》等。
2、长篇小说：
《山羊不吃天堂草》、《草房子》、《红瓦》、《根鸟》、《青铜葵花》等。
3、主要学术性著作：
《中国八十年代文学现象研究》、《面对微妙》、《曹文轩文学论集》、《思维论——对文学的哲学解释》等。
4、文章约150篇（略）
有作品翻译为英、法、日、韩等文字。
5、主编的书：
《落日红门——50年小说选》（上、下卷），大众文艺出版社，2000年
《50年儿童文学选》（上、下卷），大众文艺出版社，2000年
《国外文学导读本》（6卷），广西教育出版社，2001年
《国外儿童文学导读本》（5卷），广西教育出版社，2001年
《20世纪末中国文学作品选》（4卷），北京大学出版社，2001年
《新潮儿童文学丛书》（8卷），21世纪出版社，1989年
《现代名篇导读》（4卷），山西教育出版社，1994年
《绿色的栅栏》
短篇小说集
教育科学出版社
1993
《红帆》
短篇小说集
安徽教育出版社
1994
《水下有座城》（与左珊丹合作）
短篇小说集
黑龙江少年儿童出版社
《山羊不吃天堂草》（再版）
长篇小说
台湾民生报社
《红葫芦》
短篇小说集
台湾民生报社
《埋在雪下的小屋》
短篇小说集
台湾国际少年村
1996
《少年》
散文
台湾民生报社
《蔷薇谷》
短篇小说集
福建少年儿童出版社
1997
《曹文轩文学论集》
21世纪出版社
《红瓦黑瓦》
长篇小说
北京十月文艺出版社
《三角地》
中短篇小说集
台湾民生报社
《追随永恒》
散文集
北京大学出版社
《草房子》
长篇小说
江苏少年儿童出版社
1999
《面对微妙》
泰山出版社
《根鸟》
长篇小说
春风文艺出版社
2000
《红瓦房》
长篇小说
台湾小鲁出版社
2005
《细米》
长篇小说
江苏少年儿童出版社
《野风车》
中短篇小说集
江苏少年儿童出版社
《青铜葵花》
长篇小说
江苏少年儿童出版社
《曹文轩纯美小说系列》
系列图书
江苏少年儿童出版社
《天瓢》
长篇小说
长江文艺出版社
2007
《大王书》第一部：黄琉璃
系列作品，共四部
接力出版社
《大王书》第二部：红纱灯
系列作品，共四部
接力出版社
2008
《狗牙雨》
中短篇小说集
江苏少年儿童出版社
2009
《我的儿子皮卡》1~6册
系列作品，共16册
二十一世纪出版社
2012
《黑痴白痴》等
系列作品
中国少年儿童出版社
2013
《灰娃的高地》
