马头琴音乐曲目有《朱色烈》、《凉爽的杭盖》、《四季》、《牧马人之歌》《青松》《朝霞》《叙事曲》《蒙古小调》、《鄂尔多斯的春天》、《清凉的泉水》、《走马》和《马的步伐》、《干杯》、《蒙古小调》、《草原连着北京》、《赞歌》。《森吉德玛》、《蓝色摇篮曲》、《奔驼》、《初升的太阳》、《回旋曲》、《万马奔腾》、《欢乐的草原》、《牧马人》、《苏和的小白马》、《敖特尔青年》、《命运》、《鄂尔多斯高原》、《 安和桥》等
马头琴的传统曲目多从民歌中演化而来，可分为五类：
1、原生民歌，如《朱色恋》《八雅铃》；
2、英雄史诗曲牌，如《奔马调》《打仗调》；
3、马步调，即表现马形象的曲调；
4、从民歌发展而来的琴曲，如《荷银花》《莫德烈》等；
5、汉族古老曲调，如《普安咒》《柳青娘》等。
