在接下来的文字里，我在复述故事的部分采用“我”来指代主人公，请留意哦。
在海上航行了一阵之后，林肯号终于遇上了怪物，决定主动出击，却不料被怪物弄得人仰船翻。“我”落入水中，性命攸关之际，误打误撞爬上了一艘潜艇。没想到，所谓的怪物，就是这艘潜艇。接着，几个壮汉突然从潜艇里面冒出来，将“我”关进潜艇中的密室，这唱的是又哪出呢？幸好，“我”还有两个患难狱友，一个是有着古怪名字的仆人贡协议，另一位是林肯号上的叉鱼能手尼德·兰。
被关了几天之后，我们终于见到了小说核心人物，尼摩船长。他主动邀请“我”同游海底世界，但作为交换条件，“我”将永远不能回到岸上。“我”的好奇心一下子就被激起来了，尼摩船长为什么那么讨厌陆地？还没来得及想明白这个问题，尼摩船长就带“我”参观了鹦鹉螺号。参观过程中“我”发现，原来尼摩船长是个天才工程师，鹦鹉螺号就是他设计的；而且，他还特别有品味，会弹管风琴，又博览群书。不过，经过“我”的仔细观察，船长的书架上竟然没有一本政治类的图书，这又是为什么？上一个问题还没答案，新问题又冒出来了。听到这里，你千万别以为尼摩船长是个躲在海底的书呆子，其实他在待人处事方面手腕也很高超。比如，书里写到，船长曾让几个俘虏用不同的语言讲述林肯号的遇难经过，由此判断俘虏们没有串供或者撒谎。
海底美景坚定了“我”留在潜艇上的念头，可衣食住行怎么解决呢？这就轮到凡尔纳继续发挥想象力了。他们吃的是海龟肉、海豚肝和用鲸鱼奶做成的奶油；穿的衣料来自贝壳类动物的足丝；松软的床垫是用海藻制成的；鲸须可以当蘸水笔，墨鱼汁收集起来就成了墨水；潜艇照明和动力全都依靠电力。要知道，在现实世界中，电灯的普及使用是19世纪70年代的事，感谢凡尔纳，让小说人物提早10年用上了电灯。
凡尔纳运用想象力和科学知识构建起了一个自给自足的海底小世界，让后世的科学家、发明家们非常向往。我们前面提到，世界上第一艘核动力潜艇就是以鹦鹉螺号来命名的，这世上有成千上万种的海洋动物，为什么偏偏选中鹦鹉螺呢？因为正是鹦鹉螺的特殊结构，为人类建造潜艇提供了灵感。请你回忆一下，本期音频封面上画着的，就是鹦鹉螺的壳。鹦鹉螺的壳被多个横断的隔板分隔成三十多个独立的壳室，除了动物体所在的最后一个大壳室，其他的都充满气体。动物体慢慢长大，房室也周期性向外侧推进，建构起崭新的隔板。而各个壳室之间有一根贯穿的细管，可以把气体输送进各个壳室，通过气体的调节来操纵身体浮沉与行动。潜艇的工作原理也是这样。
鹦鹉螺号的生活惬意舒适，但广袤的海底世界一直在拨动“我”和读者的好奇心，它和我们熟悉的陆地世界到底有哪些不同呢？机会终于到来。尼摩船长邀请“我”去海底森林打猎。我们穿上潜水服，背上储气瓶，行走在海底平原的细沙上，成群结队的鱼儿替代了狮子老虎，色彩缤纷的珊瑚装点着海底森林，我们一路走马观花，一直走到幽暗的海底大峡谷深处。
在第一次和海底世界有了亲密接触之后，海上风平浪静了一阵子。可是有一天，尼摩船长二话不说又把我们几个人关了一夜，那天晚上到底发生了什么事？为什么一定要限制我们的自由？“我”有满肚子的疑问还来不及得到解答，就被叫去照顾潜艇里受伤的水手。水手最终伤重不治，悲痛的船长要举行海底葬礼，“我”由此见识到了珊瑚王国。在隐秘的珊瑚森林中有一片墓地，矗立在坟头的十字架是天然长成的珊瑚，珊瑚虫还会慢慢把墓穴包裹起来，为死去的水手带来永恒的安宁，再也不会受到世人和鲨鱼的打扰。
