ＲＮＡ中常见的ｌｏｏｐ区是由四个碱基组成的ｌｏｏｐ区域，例如ＵＵＣＧ、ＣＣＵＧ等，其中ＵＵＣＧ（ＵＮＣＧ）是非常稳定的四碱基环［３５］
ＲＮＡ的二级结构之间通过相互作用也能形成更加复杂的配对形式
其中最常见的是ＲＮＡ的假结结构（ｐｓｅｕｄｏｋｎｏｔ）［３６］，当发卡结构内的ｌｏｏｐ区域与发卡外的单链区域形成配对时，就形成了ＲＮＡ假结，ＲＮＡ假结具有多种形式，是ＲＮＡ功能多元化的重要结构基础之一
ＲＮＡ分子中各个区域进一步扭曲折叠并相互作用形成ＲＮＡ的＿－：级结构［３７］
ＲＮＡ的三级结构的形成和稳定，以及发挥功能的机制一直是人们的研究重点
与蛋白质靠疏水相互作用驱动相似，ＲＮＡ的三级结构需要通过多种相互作用来稳定，比如由于ＲＮＡ自身带负电荷，Ｍｇ２＋等金属离子需要参与稳定ＲＮＡ的三级结构，保持静电稳定
关于ＲＮＡ的四级结构目前并没有十分清晰的概念，甚至没有明确的定义ＲＮＡ的四级结构
通常情况下ＲＮＡ的四级结构１３Ｘ１指的是ＲＮＡ与其它分子之间的相互作用，可以是与小分子的相互作用，也可以是与蛋白质的相互作用
