天然水晶清澈透明，常含有云雾状、星点状或絮状气液包体，并往往有微裂纹。此外，天然水晶有偏光性，可见双晶现象，例如水晶球体，从上向下看，会见有现象。人工合成水晶或玻璃制品，体内均一纯净，毫无裂纹，内部往往有小气泡。球体由上往下看，见不到下面线条的双影。用手感识别，可感到合成水晶的比重大于天然水晶；天然水晶有冰凉之感，而玻璃有温感。
不同材质制成的假水晶的不同辨别法
当流行开来以后，市面上就出现许多仿冒品，不仅造成消费者的困扰，就是连许多商家本身也因为不够专业，而搞的一头雾水。
曾经有过的仿冒品如：
1. 压克力、塑胶制品，可以从手握的触感、温度、硬度上来分辨，此外，压克力、塑胶容易造成光线扭曲折射，一般并不难分辨，所以此种仿冒品也渐渐稀少。
2. 玻璃制品，这种一见到就是清澈如水，没有质感，且硬度低（5），单折射率，夹杂有气泡，也很好分辨。
3. 熔炼水晶，就是指国产的水晶渣合成的水晶，如同玻璃一般 ，但多已制成七、八公分至十来公分大小的圆球，非常美观好看，但是单折射率，硬度低（5），可以用偏光镜来分辨。
4. ，其实就是「铅玻璃」 ，熔有铅金属的钵璃制品，市面上最多，因为折射率、色散率都好，显得光彩夺目、耀眼动人，最适合摆设、装饰，但不适合用于灵性用途。一般多可用目视判别。
5. ，也称「养晶」 ，原石没有六方晶系结晶，这是最容易判断的地方；但若是磨成成品以后，就不好以上述的方法判别，一定要借助「紫外线光谱仪」才能分辨真假。市面上最多的是无色透明的白水晶、、、以及水蓝色的水晶仿冒品。建议各位朋友，遇到有争议的水晶矿石时，最好送请公正的第三人，如鉴定所，来鉴定分辨，所费不多，却有专业保障。如有必要，甚至送请两家以上的鉴定所来鉴定。最好，能够选购「原石」，看它的结晶形、生长纹、，就绝对不会错了。另外，就是购买含有「内包物」（Inclusion）的水晶矿石，一般人错误地称呼为杂质、瑕疵，这是「生长于自然界」的最佳证明。
