安装好Endnote之后，可以个性化设置一些常用的功能。
最常用功能介绍
Endnote可以选择本地模式或者联网模式，文献输出格式，或者联网搜索文献PDF全文，搜索Endnote导入的文献，对导入的文献进行分组等。
打开”Edit-References”，会出现这样一个对话框，可以出现下面这个对话框，可以对大小写识别，文献的信息进行选择性显示，设置文献显示的字体，对重复文献设置查找标准，在线查找文献全文，收藏文献的文件夹位置，endnote 图书馆打开设置，已读未读标注，文献类型，拼写检测，是否在endnote账号中同步，是否设置相对链接等功能。
同时，在endnote的右下角，可以对页面的布局进行设置。
通过点击author, year, title, reference type, date等按钮，可以按照作者，年份，题目，日期等信息，根据字母的顺序或者倒序，时间先后等进行排序。
