《百年孤独》抽象画作
例如，当地的神父可以在喝了一杯巧克力后离地飞起、人鬼可以自由进行交谈、冷水可以自己沸腾、人可以乘着飞毯绕村庄飞行、有的人会凭空消失……这些怪力乱神是马尔克斯打造的宇宙世界的有机组成部分，不管你喜欢或者不喜欢，他们就在那里。
宗教元素也是小说的一个特点。小说里以"殖民宗教"与"原始宗教"的碰撞为背景展开叙事，也是1492年哥伦布发现美洲新大陆后，西方宗教传入印第安人部落后真实的历史写照。
文中塑造了尼康诺·莱茵纳神父，以天主教引进者的身份出现，是马孔多镇第一位外来神父，象征着基督教对新大陆的征服。
尼康诺·莱茵纳神父认为马孔多镇居民无所顾忌的生活是一种极大的"罪孽"，希望通过自己的传经授教，让人们意识到这一点，并通过向上帝祈祷来完成救赎。倘若没有相关的宗教知识或者历史背景，要完全理解这些人物形象及其行为也是相当困难。
《百年孤独》
有人说，它的思想阴暗绝望，让人窒息这是一部充满孤独和绝望的书。例如，这本书整体就是基于一个"吉普赛人的羊皮卷上记录的梵文"来完成全书最基本的构架，这些梵文就像谶语一样，预言了加勒比海沿岸一个叫做马孔多的小镇上，布恩迪亚家族七代人的最终命运。
这种设定无疑是超现实的，正如《水浒传》里洪太尉伏魔殿里揭开的封印，或者《红楼梦》里癞头和尚的疯癫诗，暗含了"宿命论"的思想。
羊皮纸上预言已经决定了这个家族的命运，这个家族终将已"死亡"告别世界，在近乎被判"死刑"的前提下，家族里的人，都用着不同的态度，来应对共同的命运。
《百年孤独》
其中就有富于勇气开拓者，如第一代马孔多镇的建立者和开拓者何塞·阿尔卡蒂奥·布恩迪亚，他是西班牙人的后裔，来到远离海岸的印第安人村庄，在早期刚上岸时积极探索，进行科学研究、制造新式武器。
但最后他却依然没有能改变命运，正如羊皮纸书中所预言的那样，精神失常后被吊在了树上， 最终死在了那里。
也有久经沙场权势者。家族的第二代老二奥雷里亚诺参加了内战，当上上校。他一生遭遇无数暗*、埋伏、行刑甚至自*，都奇迹般地活了下来。奥雷里亚诺虽然战场、情场都是无限风光，但年老归家后郁郁寡欢，每日炼金子做成小金鱼，与他父亲一样与世隔绝、孤独终老。
同时也有沉沦女色纵欲者。阿尔卡蒂奥第二和奥雷里亚诺第二是家族第四代的孪生兄弟，其中弟弟奥雷里亚诺第二通过养殖牲畜迅速积累了财富，于是他终日纵情酒色，背着妻子与情妇佩特拉在家中厮混。
《百年孤独》
奇怪的是，每当他与情妇在一起，家畜就迅速地繁殖，一旦回到妻子身边，家业就一落千丈。奥雷里亚诺第二最后饱受病痛折磨，与哥哥一同死去。
最后出场的是默默无闻的沉思者。家族第六代唯一的男性是私生子奥雷里亚诺·布恩迪亚。他出生后一直在孤独中长大，唯一的爱好就是把自己锁在房间里，琢磨各种各样神秘的古典书籍。
甚至他还有了通灵的能力，能与死去的吉普赛人对话，并向鬼魂学习了梵文。他爱上了姨妈阿玛兰妲·乌尔苏拉，并和她在一起，但他毫不忌讳，并认为这就是爱情和幸福。
奥雷里亚诺·布恩迪亚的儿子、家族第七代继承人，却是一个长着猪尾巴的婴儿，一出生就被一群蚂蚁吃掉时，奥雷里亚诺·布恩迪亚破译了羊皮纸上的梵文："这个家族中的第一个人，将会被绑在树上；而最后一个人，将会被被蚂蚁吃掉。"
