李景隆
无论是因一次战败就被弃用的耿炳文，还是屡战屡败的李景隆，建文帝在用人这方面，确实缺乏经验，并且在战争中，他还犯下了任人唯亲的致命错误，白白葬送了中央军的性命，也让一手好牌打的稀碎。那时的局面，可以说是建文帝亲手造成的。
建文帝优柔寡断 错失良机在李景隆率军打仗失败后，建文帝认识到了军队指挥权的重要性，将军队大权交到了当时保卫济南的功臣——盛庸手中，当时朱棣所带领的燕军，在和中央军的作战中，连胜了好几次，根本没有把盛庸放在眼里，但是在东昌战役中，燕军被盛庸的部队打败，朱棣这才明白不能小看这位新上任的将领。
在齐眉山作战时，燕军与盛庸的军队交战，燕军再次被盛庸打败。在天气炎热的夏季，燕军部队中还发生了瘟疫，这些常年在北方生活的士兵哪里经受过瘟疫的折磨啊。士兵们都产生了回去的想法，朱棣以汉高祖为由鼓舞士兵，才稳住了大局。
可以说，在当时的情况下，朱棣军队的局势是很不乐观的，炎热的天气，瘟疫的出现，就算朱棣能够稳定军心，但也是暂时的。
此时朝臣向建文帝进谏，认为燕王朱棣所率领的部队，因种种原因将要北归，南京城内此时兵力空虚，如果没有守城的将领带兵，将会置之与危险之中。建文帝在听从朝臣的建议后，将徐辉祖的军队调遣回南京。
徐祖辉
建文帝的此等做法，给了正在打退堂鼓的燕军希望，既然中央军的主力部队都走了，还有什么不敢打的？之后在灵璧地区，两军爆发了战役，由于中央军的主力部队已经撤回南京，此时燕军大破南军，还抓捕了平安、徐真等将领，燕军士气大增。
在这场靖难之役中，朱棣曾率军多次冲锋在前，也正是这样，他多次身陷困境。但是建文帝却给将士们下令，说燕王朱棣是自己的叔父，无需因为打仗而背负上*害叔父的罪名。正是因为建文帝的这道指令，本该早已死在南军士兵手中的朱棣，多次活了下来。
而朱棣也知道朱允炆性格温和，孝义为先，在对战中多次为燕军首当其冲，而南军在作战中怕伤着朱棣，处处小心。燕军一鼓作气，攻下了扬州及其周边县城，朱棣率军直逼金陵，守城的李景隆等人居然直接打开城门投降了。朱棣也终于击溃了兵力强盛的南军，在这场靖难之役后，夺取了皇位。
建文帝朱允炆的一系列操作，无论是急于求成削弱藩位，还是用人的失误，这些种种原因，都在有意无意间使朱棣的慢慢强大起来，不仅让燕军获得了多次战争的胜利，还多次让朱棣死里逃生，这也导致了建文帝皇位的丢失，最终也下落不明。
在靖难之役中，朱棣确实有领军作战的军事头脑，但是建文帝自身也犯了致命的错误，就算他拥有极大的军队优势，也还是失败了。
