而根据李辉和金力的研究显示，仰韶文化的创造主体，其Y染色体类型为O3a5—M134，其中渭河流域半坡类型的群体是M134的支系M117（姜姓在M117下游里面出现的频率远高于其他支系），而后岗类型的群体则是M134的另一个支系F444，而郑州西山的人骨标本Y染色体则属于M117和F444的下游支系，表明庙底沟人群（黄帝）的确是以后起之秀的身份反噬了半坡人群（炎帝）和后岗人群（蚩尤）。
分子人类学的研究结果同时也证实了炎黄同出于少典氏，而蚩尤部族出于炎帝支系的历史记载。
当然，这里还存在一个漏洞：即M117和F444以及他们的下游支系染色体只代表炎帝、黄帝、蚩尤三个族群主体同出一脉，并不代表统治阶层也就是君主的血缘也是如此。
因为纵观中外历史，王族是外族的并不鲜见。比如历史上的越国，主体是百越族群，他们的Y染色体类型为O1a-M119，但越王却是大禹（华夏族群）后裔，也就是属于M117、F444及其下游支系。
既然搞清楚了炎帝、黄帝、蚩尤的时间和空间框架，那么接下来我们就需要回答文章开篇的疑问：
生活在山东的蚩尤和河南的黄帝打了一仗，按说属于华夏集团的内战，那为什么战败的蚩尤会变成远在南方的三苗集团的祖先呢？
按照苗族口口相传的诗歌，他们的祖先原本是生活在黄河边的，只不过是被炎黄二龙击败，才不得不南下迁徙，先过长江，后往西南。
不过，考古发现和分子人类学却并不支持三苗从北向南迁徙说。根据《战国策》记载的三苗活动范围“昔者三苗之居，左彭蠡之波，右有洞庭之水，文山在其南，而衡山在其北”，考古工作者在这里发现了屈家岭—石家河文化，年代为公元前3300年至公元前1900年。
从文化类型和时空分布判定，以江汉流域为中心的屈家岭及后续的石家河文化正是古苗民创造的史前文化。但屈家岭文化的前身是大溪文化（公元前4400至公元前3300年），也就是说，江汉流域的史前文化有着连续发展的文化系统，并无仰韶文化南下的影子。
不仅如此，按照分子人类学的研究，古苗民的Y染色体是M7，直到今天，这一染色体单倍群都是苗族同胞的典型特征，但并未发现M117甚至其上游M134单倍群，这表明从三苗时代直到现如今的苗族，都是自成一体连续发展的，没有华夏族群支系的影子。
