而在中后期的地图中，神兽也不再局限于剧情中的那几只，玩家能在各种特定地图中小概率遇到全部神兽，比如在流星瀑布遭遇急冻鸟与梦幻、在海面上遭遇洛奇亚、在日落山遭遇基拉祈等等。
不过遗憾的是，当年流传甚广的绿宝石386版几乎都容易在通关联盟冠军、前往挑战区域的船上卡机，不用金手指难以继续游戏，这也导致许多人当年并没有体验完整的绿宝石。
说到这里，笔者当时还并不知道386版都是国内厂商的翻版作品，但其实能够独立收集完全部图鉴，这已经与口袋妖怪整个系列的主旨背道而驰。当然，386版虽然改版方式简单，却合理地安排稀有妖怪的分布与遭遇概率，并不会让神兽遍地泛滥，在当时绝对是极其耐玩的游戏作品——光是抓全神兽就能消磨不短的时间。
二、漆黑的魅影
漆黑的魅影是由国内技术组所制作的一款高人气非盈利改版作品，DP收录了第四世代（珍珠钻石）、BW版收录了第五世代（黑白）中的口袋妖怪。
当然，漆黑的魅影最大亮点是编写出全新的剧情，并构架出一个独特而完整的世界观，一周目是主角的回忆，二三周目则是在主角意识恢复后与反派展开的剧情，甚至情节跌宕起伏比原版绿宝石都有过之而无不及。
增添了许多动画里才出现的角色，比如小刚、小霞、艾莉丝甚至火箭队。要知道在正版游戏与动漫中，剧情是并不互通的，部分角色可能永远也不可能出现在游戏中。但漆黑的魅影不仅打破了这种隔阂，也真正将每个角色的剧情与关系写入游戏中，这让死忠粉们也大呼过瘾。
