《一拳超人》的养成系统与其他卡牌游戏类似，包括多英雄养成和英雄深度养成。英雄深度养成包括角色养成和装备养成。角色养成又包括界限突破（消耗资源升级英雄）、角色技能（角色技能升级）、限制解除（角色升星）以及角色历程。
比较有新意的是他的羁绊系统—— “关联”。游戏角色有3-6条关联属性组合，达成相应的要求，即可激活一条关联属性。而且这个属性激活后直接生效，而不是像很多游戏要求的角色必须同时上阵才激活羁绊属性。关联属性里有两条是装备和徽章升星，剩下的关联属性则是与抽卡相关。
除了英雄养成，《一拳超人》也设置了其他卡牌游戏使用过的“家园”系统和“埼玉”系统（拼图、天赋树、和一个挂机资源出口）。
