《索菲亚的复苏》世界地图（其中蓝色为男主路线，红色为女主路线，其他颜色为支线）
男女主相见后，得知自己小时候一同被麦先骑士收养，而女主的身份竟然是索菲亚失踪已久的公主，也是索菲亚王国的唯一继承人。身为青梅竹马的两人此时却因为前方的路程发生了分歧，雅木想将里柯尔的军队赶出索菲亚，而赛莉卡一心前往米拉神殿。两人刚刚分离，一阵莫名的地震就将二队人马隔离开来，至此第三章开启。
游戏从此时开始难度明显有所提升，敌人不管是数量还是强度都有所提高，而且第三章的敌人中还出现了许多终极职业，增加了不少的难度。男主方面，在攻占了社马城堡后，雅木竟然意外拿起了王室之剑，要知道这把剑只有王族才可以使用，大家都对雅木的真实身份好奇不已。在水坝优先击败对面BOSS后，可以招揽一名女魔导师尤蒂，属性跟成长都特别优秀。
尤蒂，带有稀有装备祈祷戒指，效果是生命垂危时造成的伤害必为暴击
女主那边，在解救了困在吉斯城堡的女神祭祀后，祭祀竟然认出了赛莉卡，原来赛莉卡的母亲之前也是一位祭司，索菲亚国王垂涎她母亲的美貌，强行将其从米拉神殿带走。这位祭司将赛莉卡母亲的遗物交还与她，这遗物竟是索菲亚公主身份的象征“王冠”！剧情过后，赛莉卡的职业会强行变为“公主”，等级也重置为1，好处是等级重置后获得的经验值增加（这个设定不得不吐槽）。击败占领米拉神殿的邪术师后，众人发现米拉神殿已经破败不堪，打听得知，女神竟然被北国皇帝掳走，想借女神之身复活邪神。
吉斯城堡地形
到了第四章，游戏难度再次增加，女主线的战场改为了死亡沼泽（单位位于沼泽上每回合结束扣除5点生命值，飞行单位不受此影响），再通过迷失森林，贤者发挥出神秘的力量让雅木转职为“勇士”，等级重置并可以装备弓类装备，然后女主一行人进入邪神塔并被困于塔中。
