然而暗地里“培育屋”却做着不可告人的勾当！从第二世代《宝可梦：金/银》开始只要性别不同且符合蛋群相同规则的两只宝可梦寄放在一起，就有一定概率诞生“宝可梦蛋”。万万没想到，宝可梦在培育屋里竟然做出了这种事，而培育屋的老奶奶还能熟视无睹！
第二世代《宝可梦：金/银》由于首次引入“孵蛋”概念，在“宝可梦蛋”概率上显得比较稚嫩。隐藏设定是玩家控制的主角每走一步，都有可能创造出“蛋”。而从第三世代开始，变成了每走256步后自查一次是否已经创造出“蛋”。当然，这个概率也是受到宝可梦种类、训练家身份、道具影响的。
亲代同类且初训家（最初获得该宝可梦的训练家）不同时，生蛋概率为69.3%；同类且初训家相同或者不同类且初训家不同的话，通过率是49.5%；不同类且初训家相同的话，通过率是19.8%。从第五世代开始，如果已获得了圆形护符，则几率会分别提高至87.8%、79.5%和39.3%——以上数据来源为维基百科。
上文说过，只要性别不同且符合“蛋群”规则，宝可梦就能生蛋。所谓的蛋群规则在第三世代也得到了完善。通常情况下，蛋群相同的宝可梦，子代会呈现出母系进化链的最低形态。比如地鼠与吼鲸王（母）为亲代的情况下，蛋孵宝可梦就会出现吼鲸王进化链最低端的吼吼鲸。
另外在蛋群规则外还需要考虑一只独特的宝可梦“百变怪”。百变怪在众多宝可梦作品中虽然谈不上主角，但是戏份还是相当多的。身为一只连神兽都能变化出来的“变身宝可梦”，它可是骗过很多训练家的眼睛。当百变怪参与“孵蛋”这项伟大工程时，它的作用就凸显出来了——可以与除了“未发现群”外的其他蛋群宝可梦生蛋，且子代为非百变怪一方的进化链最低形态。这很好理解，权当是百变怪变成了宝可梦们最喜欢的“异性”。那么问题来了：究竟是其他蛋群宝可梦绿了百变怪，还是百变怪绿了其他宝可梦呢？
