在这场动乱结束后，阿泰尔并没有对曾经与自己刀剑相向的同袍实施报复，而是恪守着刺客组织的信条，不进行兄弟之间的残*。同时阿泰尔也向一种刺客解释了阿尔莫林的所作所为，最终阿泰尔赢得了整个刺客组织的尊重，信任与忠诚，他也成为了新一代的刺客导师，让刺客组织变得更加壮大。
在成为导师之后，他大幅地改变了那些刺客们世代遵守的行为准则与仪式。圣殿骑士开始将他们的行为变得隐秘起来，于是阿泰尔也将自己的组织变得隐秘：他放弃了刺客所有的堡垒，并让他们的行动转入地下。他恢复了毒药的使用，因为他认为不能使用毒药并没有什么好处；他还借助伊甸苹果中获得的知识改良了刺客世代相传的武器袖剑，让手指不再挡住刀刃，刺客们也不需要再将切除无名指当作必须完成的仪式。
美好时光
阿尔莫林死后一个月，十字军东征仍在继续，圣殿骑士在新团长——阿曼德·波查特的领导下，又计划着新的图谋，阿泰尔并不愿意坐等敌人来袭，于是决定主动向他们采取行动。
阿泰尔领导了对海港城堡的袭击，在那里又见到了之前在葬礼上假扮罗伯特的女圣殿骑士：玛利亚。阿泰尔制服玛利亚后，从她口中得知，圣殿骑士准备前往塞浦路斯，那是个刚被圣殿骑士从狮心王理查那儿买来的岛。这次的相遇让两个身处敌对阵营的男女都产生了不一样的感觉，虽然两人见面后再次刀剑相向，但再次取胜后的阿泰尔依然没有选择除掉敌人，而是将玛利亚带在了身边，一起赶到了塞浦路斯。
玛丽亚
在经过一系列变故后，两人再次失散，此时的阿泰尔终于意识到自己是如此的在乎玛利亚的安危。经过多方寻找后，阿泰尔再次见到了玛利亚，不过此时的玛利亚已经被圣殿骑士团当作了叛徒，对于一个前首领的替身以及能够两次从刺客手中安全脱身的圣殿骑士，自然很难得到现任圣殿骑士团首领的信任。阿泰尔干掉了看管玛利亚的守卫，将其解救出来。在经过一番激烈的辩论后，阿泰尔成果动摇了玛利亚对于圣殿骑士的信仰。再后来，随着两人相处时间的增加，彼此之间的隔阂越来越少，感情日渐加深。
1193年，在刺客导师阿泰尔28岁这年，他与玛利亚在利马索正式结为夫妻，随后他们返回了马斯亚夫。婚后，玛利亚为阿泰尔剩下了两个儿子，大儿子取名达理姆，二儿子取名塞夫。
此后，阿泰尔重新投入到对伊甸苹果的研究以及刺客组织的发展上。大概在1204年左右，阿泰尔开始在一些地方建立刺客组织，不过到了君士坦丁堡时，因为第四次十字军东征在民众里造成了*乱，阿泰尔被迫撤离。随着对伊甸苹果研究的深入，阿泰尔又发明了袖枪等武器，并利用研究过程中发现的一种未知金属为自己打造了一套铠甲。
在阿泰尔波澜壮阔的一生中，这段时间总的来说相对平静，玛利亚的陪伴和悉心照料也让阿泰尔倍感温暖，可谓这位刺客导师一生中最美好的一段时光。
蒙古之行
1217年，阿泰尔得到了来自遥远东方的消息，蒙古大汗铁木真的军队正迅速向西方逼近，并且刻意阻止刺客组织的发展。根据之前得到的伊甸苹果碎片的地图和各种消息，阿泰尔怀疑其中一块碎片正是在铁木真的手中。于是便带着玛利亚和大儿子达理姆启程前往蒙古，留下已有妻儿的小儿子塞夫，并让他的挚友马利克临时执掌刺客组织。
到达蒙古后，阿泰尔与当地刺客高曲兰会合，经过数次波折后，他们成功刺*了铁木真。任务完成后，阿泰尔一家便启程返回马斯亚夫，这一来一回就用了十年的时间。
