因为背景采用的是新水晶神话，这部份的内容需要玩家自行补课查找原因，总之我们需要知道的，就是神的目的是打开不可视世界的大门。为此有两种做法，一是将大批灵魂一次送入，做法就是等到没有战争出现后，就派出审判者毁灭世界重新开过；二是挑选特质的灵魂令其不断转生成为阿基托（觉醒者）。在实验了6亿多次后，就有了第0班——主角团的14人，他们就是这批特质灵魂的转生。
由于水晶的能力远超人们的想象，很快人们便围绕着4个水晶建立起4个国度，分别为魔法专精的朱雀，科技点满的白虎，追求大自然和谐的苍龙，与还没出来就被白虎炸了的玄武。蓄谋已久的白虎国元帅希德发动了政变，成为了皇国领袖，并且控制了白虎水晶，同时向朱雀宣战。
当时的白虎凭借着水晶干扰器，让全靠魔法，且能召唤圣兽的朱雀瞬间失去了战斗力，并将朱雀的主力部队尽数消灭。好在第0班及时出现，让整个战局得到了扭转，只因第0班的人都是特质灵魂的转生，在使用魔法方面不受水晶的限制，很快便击退了白虎军。自此，有了第0班的加入，节节胜利的朱雀也开始了领地收复计划。
就在第0班即将把领地全部收复之时，各国却约定了停战，并且首脑们都约定要进行会谈。但没有意外的话很快就出现了意外，苍龙的女王被暗*死亡了，幕后黑手是白虎。因为忌惮第0班一个人就是一支军队的强悍实力，所以白虎就使出这招，顺便就将此罪名安在了第0班头上，意图将其消灭在白虎境内，同时还能联合苍龙一同对付朱雀。但0班还是凭借着强悍的实力突围并且回到朱雀。
此时苍龙与白虎也即将进攻朱雀，在艰难地战胜苍龙后，朱雀的兵力已不足以抵挡白虎的进攻，于是朱雀的院长做出了决定，要用1000人献祭召唤秘匿大军神！第0班也在此奋力抵抗敌人的进攻为召唤争取了时间。很快军神被成功召唤，一击便让白虎军主力化为乌有，就连白虎国的城池也都被开了个大洞。虽然赢了，但可悲的是，朱雀国的牺牲也都非常惨重，这场战争只能说是惨胜，至于白虎的领袖希德，则是不翼而飞。
