宣德十年（1435年），即孙氏上位7年后，年仅38岁的明宣宗便英年早逝了。年仅9岁的朱祁镇即位，是为明英宗，而孙氏则顺理成章地进位为皇太后。
英宗即位之初，朝政由太皇太后张氏在操控，正统七年（1442年）十月张氏薨逝。随后，孙皇后的影响力才得以提升；但同时，宦官弄权现象也日益明显了起来！
正统十四年（1449年），明英宗在大宦官王振的蛊惑下，带二十多万明军精锐御驾亲征瓦剌，结果在土木堡遭遇围歼，英宗朱祁镇被俘。
这时，孙太后走向了大明王朝政治舞台的中心，她审时度势，痛斥了部分意欲南逃的朝臣；接受了兵部侍郎于谦等人的建议，将郕王朱祁钰（明英宗的异母弟）扶上帝位，立朱祁镇的儿子朱见深为太子，遥尊朱祁镇为太上皇！这一举措彻底粉碎了瓦剌部头目也先挟朱祁镇向大明攻城掠地、以赚起大明利益的阴谋，化解了大明王朝一场空前严重的政治与军事危机！
而朱祁钰上台后，压根不提迎回兄长的事，孙太后对此不动声色，她屡次三番地派人给明英宗寄去御寒的棉衣，以坚定儿子生存下去的信念。
礼部左侍郎杨善奉命出使瓦剌后巧妙斡旋，迎回了明英宗。明英宗回到北京后被朱祁珏幽禁于南宫，宫门的锁被灌铅水，南宫周围的树木也被砍伐殆尽，以防这位先皇与旧臣接触而节外生枝！
孙太后依然不提抗议：她悉心地保护好被幽禁的朱祁镇和孙儿朱见深，静待时局的改变。
景泰八年（1457）正月，朱祁珏卧病不起，早先，他自己立的太子朱见济与杭皇后已先后离世。此时，徐有贞、石亨、曹洁祥等人乘机发动了“夺门之变”，重新迎立明英宗复辟了皇位，夺门之变是在孙氏明确的支持下进行的。保证了政权的平稳过渡！
“石亨谋夺门，密白于太后，许之。”《明史·卷一百一十三》
天顺六年（1462年）九月，60岁左右的孙太后薨逝。孙氏之所以在历史上留下了浓墨重彩是因为她长袖善舞、使大明王朝渡过了两场劫难，于风口浪尖上稳住了大明王朝的航向，从而避免了山河变色与生灵涂炭，为大明王朝的国祚延续作出了贡献！
