沙罗在车上告诉真木，变成异生兽的贵文其实是她的恋人，本来他们已经打算结婚并且组建家庭了，所以当贵文逃走的时候沙罗一时心软没有开枪，导致了事情一发不可收拾，现在她要弥补过错，将贵文消灭。
两人一起来到阴暗的地下，这个时候真木感知到了贵文的存在，然而出乎所有人意料的是贵文竟然显得十分狼狈地走出来，要知道在此前他才吃掉了一群工人。原来贵文是在故意示弱，但是沙罗还是选择了开枪，只是因为情绪激动，开了五枪只命中了一枪，随后贵文的手变长将沙罗抓住，沙罗抓住机会开出了最后一枪。
愤怒的贵文随即变异，而且想要继续袭击沙罗，真木随即阻止，对峙之中两人都完成了变身。一番打斗之后，异生兽发现自己不是对手，随即使用音波逼出了大量的老鼠，并且还吸收了这一堆老鼠进化为进化形态，最后大到地下已经容纳不下，于是异生兽破土而出，开始到处破坏，人们惊慌逃亡。
而奈克斯特奥特曼为了救一对母女也完成了进化，从幼年形态进化为成年形态，然后又是一番恶战。在战斗中为了躲避始祖灭绝光弹，真木控制奈克斯特飞了起来，身为飞行员的真木感到非常激动，他竟然不依靠战斗机就能够在天空飞翔。可是异生兽又吸收了一大批的乌鸦进化为有翼形态，双方展开了空战。
可是奈克斯特奥特曼因为不愿意完全侵蚀真木，战斗中落于下风，关键时刻真木的战友带领战斗机群前来支援，奈克斯特则是抓住机会和三日月形的光刃切割了异生兽始祖的翅膀，随后从双手产生强烈的能量后组成十字形，将光能量以奔流形式放射而出的奈克斯特的最终究极光线将异生兽粉碎。
然而异生兽始祖虽然被真木消灭，可是始祖的细胞却没有完全消失，在《奈克瑟斯奥特曼》里，这些细胞不断进化，不断袭击人类，而人类则是成立了夜袭队来对抗，这是后话，暂且不提。
