再说故事，本片在情节方面融合了历史传说，讲述了民国时期一群爱国仁人志士，为了保护失落千年的国宝《华佗医书残卷》，而展开的一系列冒险斗争故事。
电影开始于一段历史传说，相传三国时期，枭雄曹操患有风涎症，导致被头疼病所困扰，每次头痛症发作时，都让曹操头痛欲裂。
为了缓解痛苦，曹操下令征召隐居多年的神医华佗，前来为自己治病。
与此同时，曹操的敌对势力也收到了情报，为阻止华佗医治曹操，纷纷派出刺客沿途暗*伏击。幸而曹操手下的心腹大进军于禁一路护送，成功护送华佗入宫。
华佗见到头疼欲裂的曹操，当即和随行的女弟子一起为他治疗，用针灸术替曹操缓解痛苦。
曹操的头疼病果然好转，华佗却说，银针只能治标不能治本，要想彻底根治头疼病，必须做开颅手术。
华佗说出曹操的病因，性格多疑的曹操却认为对方想要谋害自己，当场下令将华佗下狱处死。目睹整个过程的于禁深感愧疚，认为是自己害了华佗。
