独孤皇后的丧事规格之高，是异常罕见的：皇后丧事由隋朝尚书左仆射（也就是宰相）杨素亲自负责。杨素不仅要统筹安排丧葬各项事宜，而他身为宰相居然带着人马日晒雨淋，亲自到荒郊野外之中为皇后寻找福地。不仅如此，选好地址为皇后建设山陵时，杨素也始终坚持在第一线，凡事亲力亲为、辛苦不已，连隋文帝都被他感动了。隋文帝后来在表彰杨素的诏书中称，杨素为皇后寻访山陵办后事的功劳，比他南征北战平戎定寇的功绩还重要 。杨素是平陈统一全国的一支主力，之后又转战江南各地两年多平叛，而且开皇末年数次出击突厥。也就是说，在隋文帝看来，皇后等同于他的人生功业。
皇后的丧仪史书没有记载细节，不过从佛教典籍里透露的一鳞半爪，可以想象当初葬礼的盛大。根据《续高僧传》等记载，“献后之丧，福事宏显”。皇后去世后，隋文帝即召高僧大德五十余人进宫，在皇宫内举行了七七四十九天的宏大法会超度皇后亡魂 ，然后又讲《净名经》(即《维摩诘经》)，皇太子杨广亲临听讲，参加的大德皆为“四海宗师，一时翘楚” 。据《续高僧传》记载，有善权、立身、智脱、慧海等。此外，汉王杨谅从晋阳带回高僧志念，自为施主，为母亲经营法祀。扬州的天台国清寺也为大行皇后举办法事祈福超度，隋文帝厚加赏赐 。
隋朝为独孤皇后上谥号为“献”，根据《逸周书》对谥法的解释，献者：聪明睿智曰献、贤德有成曰献、智能翼君曰献。同年闰十月，隋文帝又做了一件相当震撼的举动：晚年迷信、已经62岁的他，决定亲自为妻送葬。术士萧吉劝谏和告诫道：“根据阴阳书，皇帝今年送葬对自身是不利的”。隋文帝却置之不理 。垂暮的他冒着严寒亲自奔波了数百里把爱妻送到太陵陵园。当初他把14岁的小新娘伽罗接回来，她从此成为了他血肉相融的一部分，如今阴阳两隔，他要陪着心爱的伽罗走完人生最后一程。
仁寿四年七月，隋文帝病逝，十月帝后合葬太陵。大业年间，隋炀帝曾在太陵立寺为父母祈祷冥福 。太陵位于今天陕西省咸阳市杨凌区三畤原上的五泉镇王上村，陵寝至今犹存。经过考古勘探，证实了太陵确为文献所记载的“同坟而异穴”，也即帝后各自拥有独立墓室，位于同一封土之下。这表明礼制在尊崇“一人之下，万人之上”的皇后地位时，同时也注重家庭关系。
