僧值和尚指斥觉远目露凶光满脸*气，恼怒之下罚其面壁三天不许练武。觉远出家报仇的初衷受挫一气之下离开了少林寺。秃鹰一伙在各处横行霸道，滥*生灵强抢牧羊女。觉远在芦苇丛中遇到只身躲避追兵围*的李世民，觉远挺身相救被李世民铭记在心。花天酒地的王仁则兽性发作妄图强暴被吊起来的牧羊女。
此时觉远已冲到王仁则门前与秃鹰一伙展开拼*，秃鹰抵挡不住觉远凌厉的棍棒被击倒在地。觉远只身*入王仁则的府地。王仁则正想侮辱牧羊女，觉远一棍打来王仁则猝不及防退到桌后，仇恨满腔的觉远与怒火中烧的王仁则展开了殊死搏斗。觉远以令人眼花缭乱的棍棒使酒后的王仁则只能连连招架，狡猾的王仁则将计就计使出醉剑；觉远识破了对方的招数用醉棍对醉剑，觉远奋力救出牧羊女。二人且战且退，终因寡不敌众觉远又身负剑伤，只好撤出了王位则的府第。
觉远报仇未果在牧羊女的劝解之下重新回到了少林寺，得到师傅和师兄们的理解。从此觉远怀着报仇的决心和顽强意志。苦练武艺无论是烈日炎炎的盛夏还是瑞雪纷飞的寒冬日夜不辍，一日李世民被王仁则兵马追*，被觉远遇见他带李世民逃入少林寺周边的塔林。塔林是历代高僧安息之地，妄图闯入塔林的王仁则的追兵被师徒们强行截住。觉远等人施计将李世民解救。李世民急于过黄河觉远和牧羊女装扮成一对新婚夫妻。
李世民装作护送新娘的媒婆贿赂了巡查的官兵，但还是引起了他们的注意。觉远和牧羊女在黄河边卸妆时，双双望着对方情不自禁萌生爱意。追兵赶到乱箭齐发，李世民脚负箭伤，觉远急忙上前救助只身迎战人马。李世民在牧羊女的护送下渡过黄河。师傅率众弟子赶到佛门禁开*戒，追兵肆无忌惮对武僧刀枪相向，蛇蝎缠身应还招我佛慈悲亦惩恶。
少林弟子以精到的十八般武艺与追兵展开了一场殊死搏斗，觉远一怒之下犯了*戒。师兄们说觉远是为佛度人善哉善哉。师傅怒斥觉远：六根不净与佛无缘，与其断绝法缘任他远走高飞不准再回少林寺。
其实王仁则此时正在寺内等候逼迫交出觉远。觉远为了不连累大家执意，要回到寺中与王仁则一拼众师兄全力阻挡，王仁则认定少林寺"通敌谋反"，勒令少林寺三天之内交出"人犯"，否则就要灭掉少林。
王仁则得知李世民被觉远营救巡河官兵被*的消息后传令立即进军少林寺。王仁则重兵闯入少林寺，方丈为保护少林圣地誓死不屈宁愿承担一切，被王仁则用烈火烧死。师傅带领众僧与王仁则的兵马浴血奋战昙宗在激战，中中箭身亡。觉远和牧羊女赶来参战并告诉众僧：李世民已率大军渡过黄河直取东都。
王仁则带兵返回见东都已被李世民的军队攻破，王仁则腹背受敌只能再调转马头与少林弟子们在黄河岸边决一死战。觉远面对*父的仇人义愤填膺勇猛无比；王仁则走投无路作垂死挣扎最后终于被觉远手刃，觉远报了*父之仇为继承昙宗师傅保护少林，匡扶正义的遗志觉远决心皈依佛祖，受戒为僧并割断了与牧羊女之间的生死情缘。
唐太宗李世民为了表彰少林寺十三棍僧义勇给少林寺封地加禄让其自立营盘豢养僧兵，并开放酒肉之戒。自此少林寺习武之风大盛少林功夫名传天下广及四海。
