《湄公河行动》是根据中国警察第一次境外执法改编的电影
酷爱拍摄动作片的林超贤接到这个题材非常兴奋，自从2012年拍完《逆战》，他的感觉是身体已经被掏空，如果再拍，自己需要一个期待和挑战，“终于有一个故事去拍香港地域背景以外的动作片，就像美国的海豹突击队执法，一听就很想拍”。
《湄公河行动》是根据中国警察第一次境外执法改编的电影，监制黄建新说，以前中国在“境外持枪”这样的题材上没有开放过，《湄公河行动》是一次突破。此前陈宝国等演员拍过一部电视剧《湄公河大案》，但摄制组基本没有出境，情节虚构较多，对抓捕糯康的核心内容也并未过多展现。
剧本审查意见几十条，林超贤曾经想退出
张涵予饰演缉毒队长高刚，在片中他变成了“武打演员”，在40度高温下拍戏，是“咬着牙坚持下来的”
对于这样重大而敏感的“主旋律”题材，拿到拍摄权只是漫漫长征的第一步，在与公安部讨论剧本的过程中，作为一名在香港拍惯了商业片的导演，林超贤一度想放弃。
总顾问刘跃进与监制黄建新、梁凤英、林超贤、彭于晏、陈宝国出席首映
以一次剧本讨论会为例，林超贤称：“他们都很偏激，说这不行，那也不行，我听了以后很尴尬。”讨论会结束后，他跟黄建新说，“如果按照他们的方向去拍，那这部电影基本上不用拍了”。黄建新参与过多部主旋律商业大片的监制工作，对此有着自己的经验判断，他告诉林超贤：“没事，他们现在处在一个层面上，都会这样。你听完就算了，不用太在意，其实另外一个层面的人出来讲的那些话，又会完全不一样。”黄建新安慰林超贤，还是用商业电影的考量去判断这次拍摄，他说当年拍《黑炮事件》，批评点有几百个，“他们才批评你二三十个点，跟我那些比真得太简单了”。
《湄公河行动》中不乏血腥暴力镜头，许多戏都是实景拍摄，包括曼谷火车站的追捕戏，耗资不菲
