阿宝的小浣熊师父退休了，于是教导“盖世五侠”的重任落到了身为“神龙大侠”的阿宝身上。
如果说功夫熊猫第二部的关键是太极，那么第三部则把重点放在了“气”上面。
武学泰斗乌龟大师可以说是熊猫阿宝的伯乐。
在功夫熊猫第一部中，乌龟大师结束了长达千年的人生，化作桃花逝去，最终意识来到了灵界。
而功夫熊猫第三部中的大反派正是来自灵界的天煞。
原来，天煞原本是乌龟大师的结义兄弟，乌龟大师受伤时是天煞带着他到处求医，后来在山里找到了会气功的大熊猫们，大熊猫用气治愈了乌龟大师。
天煞渴望气带来的力量，瞬间黑化开始抢夺大熊猫们的气，乌龟大师为了阻止天煞，将他放逐到了灵界。
但是随着乌龟大师也来到灵界，在这里天煞再次和乌龟大师展开了一场生死对决。
原来，天煞已经在灵界呆了整整500年，这500年来他吸走了所有来到灵界的功夫大师的气，乌龟大师的到来，然后吸走他的气则是天煞重返人间的最后一块拼图！
随着天煞吸收乌龟大师的气，通往人间的通道终于被打开，无数听从天煞命令的傀儡被召唤出来，这个世界危在旦夕！
