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《火影忍者：疾风传》花了一些时间来探索勇者自来也（大塚芳忠）——一位传奇忍者大师，也是鸣人的教父。自来也的目标是发现晓组织首领佩恩（堀内贤佑）的真实身份。即使是像自来也这样经验丰富的人也无法预测这个反派的真实身份。
这段小故事不仅向我们展示了自来也是一位多么高超的大师，还展示了佩恩的力量。自来也收集到的情报对木叶备战大有裨益。
兄弟之战篇 (第 134 至 143 集)
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佐助终于追上了鼬，却发现他哥哥的行为比他最初意识到的要复杂得多。两人展开了一场战斗，这场战斗很快成为动漫传奇。佐助现在必须反省自己，看看他的生活是否还有更多值得追求的东西，因为他对正义的追求已经结束了。
佩恩的突袭篇（152-175）
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得知鸣人是九尾妖怪之一的宿主后，佩恩和晓组织对木叶发动了大规模入侵。幸运的是，鸣人一直在接受圣人的训练，这让他获得了帮助盟友所需的力量。木叶忍者竭尽全力击退了进攻，取得了充满希望的胜利，但也给木叶造成了重大损失。
痛苦篇被广泛认为是整个火影忍者系列中最好的故事情节，而这场战争的极快速度完美地诠释了为什么该系列至今仍如此受人喜爱。
五影顶峰篇（197-214）
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世界各国*已经非常清楚，晓组织已经成为一个不容忽视的巨大威胁。这导致了五影峰会的召开，这也是五影第二次举行这样的会议——历史性的聚会导致了历史性战争的宣告。
不幸的是，佐助和他的团队（Taka）对影有不同的计划。宇智波家的最后一个儿子认为影是过去战争的根源，是他家族灭亡的根源，也是晓组织成立的唯一助力。这位年轻的忍者决定亲自处理此事。
第四次忍者大战：倒计时篇（第 215-222 集和第 243-256 集）
