该剧根据张宝瑞同名长篇小说改编，故事讲述了二十世纪50年代，中国核工业计划启动，龙飞负责护送核专家任务。在列车上，龙飞发现并阻止了破坏行动，但列车爆炸导致四位核专家遇难。龙飞在调查过程中遭遇核科学家助手谢宝音。同时，龙飞的女友杜明明与其同事肖克发展恋情，并陷入与梅花组织特务周明天的“三角关系”，最终遇害。被劫持的核专家被揭为假冒者，周明天并非爆炸案真凶。龙飞发现梅花组织头目潜伏在公安内部。谢宝音企图毒害龙飞等人并自*。龙飞意识到梅花组织更大阴谋的存在。
作为《梅花档案》的续篇，延续了前作惊险玄疑风格。故事情节涵盖碎尸案、四角恋情以及两派梅花党组织间的激烈斗争。将敌我混杂、正邪难分的斗争刻画得淋漓尽致。
除了视觉冲击外，更注重营造心理紧张感和刺激感，誓言将悬疑神秘进行到底。计中计、案中案的设计，悬念迭起，环环相扣，引人入胜。
《谍影重重之上海》是由黄文利执导，秦海璐、廖凡、李光洁、尹娟、孙逊等人主演。2009年于央视八套播出。
