答案是：签订协议的房屋征收部门。
拆迁协议是我们领取拆迁补偿款和选择安置房的重要依据，拆迁协议至少一式两份或三份，拆迁双方各执一份，国有或集体土地所有单位一份(村委会或社区居委会或企事业单位)，我们自己的一份一定要保存好。如果拆迁补偿款还没有到位拆迁协议却不幸遗失，最好向房屋征收部门说明情况，借用协议原件复印一份然后盖章(不盖章的没有法律效力)，最大限度的保护自身的合法权益。
如果跟我们协议的房屋征收部门是临时成立的，事后取消了怎么办?这个问题需要我们参考当地的房屋征收与补偿操作规程(俗称：拆迁程序)。
以《兰州市国有土地上房屋征收与补偿操作规程》为例，第五十二条 征收补偿资料整理归档，明确告知区、县房屋征收部门负责包含拆迁协议在内的所有资料的归档和保存，如果和我们签署协议的临时拆迁部门取消了，就需要我们向区、县房屋征收部门申请补办拆迁协议。
区、县房屋征收部门复制归档和保存的资料内容：
征收项目管理综合档案：征收项目申请资料、征收范围红线图、委托合同、房屋调查结果及公示情况、调查登记认定处理情况、补偿方案论证资料及审查意见、征收补偿方案征求意见情况及根据公众意见修改情况、听证会的资料、社会稳定风险评估报告、作出征收决定的会议纪要、房屋征收决定、征收补偿方案、被征收房屋及安置房屋整体评估报告、评估机构选定有关资料、补偿决定及相关资料、申请法院强制执行相关资料、分户补偿情况公示以及与征收补偿相关的文字、图表、声像等资料。
分户补偿档案：征收补偿协议书、被征收人、公房承租人身份及户籍证明、被征收房地产权属相关材料(复印件)、公有房屋承租证明、相关经营凭证、摸底情况调查表、调查登记认定情况、分户评估报告及测绘资料、装修评估表、相关会议纪要、选房确认书、相关费用补偿明细表、货币补偿款及补助奖励费用领款表单凭证、房屋附属物和其他各类补偿款收据、复核评估报告、专家委员会鉴定结果、补偿决定、各种文书送达回执及有关影像资料、信访材料、被征收房屋室内外照片及录像等与补偿有关的资料等。
律师提醒：虽然拆迁协议可以补办，但是不排除跟我们签订协议的部门是政府为了征收项目授权临时成立的部门，征收完成后是会撤销的。你可能会面临找不到负责人的尴尬处境，需要其他部门进行协调，致使补办协议需要很长时间。所以我们一定不能马虎，把拆迁协议放在安全明显的位置，防止拆迁协议丢失。
