染色体重排的过程
染色体重排可能首先通过随机漂移在一个小的局部群体中建立，无论祖先物种分布的区域是否在外围还是内部。
如果其个体在该区域中表现出高适应性，并促进合子前分离机制的进化，这将会抑制杂交种的形成。
该模型进一步指出，如果杂交种的适应度降低，则染色体突变将被选中，然后从种群中消除。
可能的合子前分离机制概述
尽管有小概率情况下会发生随机漂移，但因为它不太可能在其祖先群体中建立降低杂合子适应性的染色体重排。
尤其在杂交劣势只是非常轻微的状态下，生殖隔离的自然选择也会变得很弱。
人类黑猩猩染色体图谱
科学家在对人类物种形成的基因研究中证实，人类和黑猩猩之间发生了大量的染色体重排。
尤其是九条染色体在人类核黑猩猩之间表现出中心到位的现象。
九条染色体中包括1、4、5、9、12、15、16、17，其中人类第二号染色体代表黑猩猩中存在的两条近端着丝粒染色体的融合。
其他染色体则有12、13号，如果这些染色体重排发生在黑猩猩和人类祖先种群分化的早期，那么它们在分化种群中偏向等位基因将被困在染色体屏障上。
人类和黑猩猩 7 号染色体信息图
因此这会导致两个群体在适应自身不同普遍环境时发生基因分化，不相容的积累会逐渐导致生殖隔离和物种形成。
人类与猩猩DNA测序中，科学家如今可以通过更为先进的技术进行遗传学考证，从而可以在去全基因组范围内识别与生殖隔离的基因座，并在不同谱系间进行比较。
