但是贝加尔湖是个例外，首先是因为贝加尔湖拥有多达336条河流的注入河流，其中最大的注入河流为色楞格河，色楞格河流经的区域地势平稳，且河水中生长着旺盛的水草，可以过滤水中的泥沙。
再加上色楞格河在注入贝加尔湖时，在注入口形成了三角洲，泥沙进一步被阻拦，所以进入到贝加尔湖的河水较为清澈，这也使得贝加尔湖的湖水可见度非常高，在冬季时可见度甚至能达到30-40米深。
另外，贝加尔湖的深度和它的形成有关。科学家们通过对贝加尔湖湖底的沉积物研究发现，该湖泊已经存在地球上2500万-3000万年，形成原因则和地震有关。
贝加尔湖位于板块交界地带，使得这里的地震非常频繁，时至今日当地每年还会发生多次地震，只是大多数地震是无感地震，只有通过专业设备才能感知到的地震。地震使得贝加尔湖仍旧在不断发育，据了解，现如今的贝加尔湖裂谷每年扩大2厘米，深度也在不断加深。
正是因为贝加尔湖在不断扩大之中，所以有人怀疑，贝加尔湖未来会不会形成海洋。
事实上，如果当地一直保持着面积扩大的趋势，或许有一天贝加尔湖会扩大成为海洋。
