取自《昌邑文史》
1955年第一区恢复昌邑区称谓，辖区又有一部分划归哈达湾区。在大跃进的时代背景下，1959年1月12日，昌邑区划分为昌邑、铁路两个城市人民公社。昌邑人民公社下辖巴虎屯、新地号、维昌、东大滩、东局子、文庙、怡春里、车站、桃园路、东红10个管理区；铁路人民公社下辖民主路、站前、铁川3个管理区。同年，因通天区撤销，民生路、大东门、中兴屯、南马路、朝阳等5个改为管理区的街道办事处划归昌邑人民公社，即有15个管理区由昌邑人民公社管理。1960年昌邑人民公社下辖的15个管理区合并为7个分社。到了1962年3月28日，城市人民公社被撤销，昌邑、铁路两个人民公社合并，恢复昌邑区人民委员会，辖区北起莲花泡，南到江湾路，东起江岸，西达珲春街。
图片取自《昌邑区志》
1964年，昌邑区区划再次出现变化。1月份，昌邑区西界由珲春街退至南京街；8月5日哈达湾区撤销，该区所属哈达湾、兴华、莲花泡等街道并入昌邑区；10月原属郊区的九站等4个大队组成九站街道办事处，划归昌邑区；另外原属郊区的三道岭子等3个生产队也被划入昌邑区。经过一系列调整，昌邑区管辖区域西起南京街，东、南、北三面滨江，西北囊括九站在内的松花江左岸广大区域，管辖面积达到48.32平方公里。
1969年，九站等处重新划归郊区，昌邑区面积有所减少。此后多年，经过一系列内部拆并，到1986年，形成了昌邑区人民政府（1980年11月4日由昌邑区革命委员会变更而来）领属下东局子、新地号、延安、文庙、站前、民主、南京、莲花、通江、兴华、哈达湾、新建、延江等13个街道办事的管理格局。
图片取自《昌邑文史》
1992年3月4日，吉林市调整行政区划，原郊区九站乡、孤店子镇、双吉街道、九站划归昌邑区。同时，将昌邑区所属南京街道和站前街道吉林大街以西部分区域划归船营区管辖。经过这次调整，全区共有14个街道办事处和九站乡、孤店子镇两个乡镇，面积增加到253平方公里。1998年2月市政府将九站街道和九站乡划出，成立吉林经济技术开发区，昌邑区面积缩减为119平方公里。1998年5月站前和文庙街道划出部分区域，组建东市商贸经济示范区。1999年又组建了虹园经济开发区和幸福经济示范区。2000年1月1日，原属永吉县的两家子满族乡、土城子满族朝族乡、河湾子镇、桦皮厂镇和原船营区的左家镇划归昌邑区管辖。昌邑区下辖13个街道办事处，2个乡，4个镇，3个经济开发区，面积达到769.92平方公里。
