dna的化学结构图,dna化学物质组成

首页 > 家居 > 作者:YD1662024-04-12 17:30:19

小编今天给大家介绍一款在线绘制基因结构的工具Gene Structure Dispaly Server,简单好用功能还挺强大。运用它能够绘制清晰的基因结构,清晰明了地展示外显子、内含子及UTR的位置。还可以联合其他数据绘制进化树-基因结构图,展现基因结构与系统进化关系。

dna的化学结构图,dna化学物质组成(1)

打开这个工具,它的界面如下:

dna的化学结构图,dna化学物质组成(2)

1.数据输入类型

绘图的输入文件有四种类型的数据可选:

BED :大家可以在基因组GFF文件筛选基因的这些信息,第一列是基因ID,第二列是起始位置,第三列是终止位置,第四列是基因在这个位置是外显子还是UTR,第四列是注释信息,第四列可以不要

GenBank Accession Number or GI:可以从GenBank获得,要注意的是你输入的Accession Number or GI必须包含有mRNA序列

GTF/GFF3:基因注释文件(包含基因的结构信息,具体信息可以自行百度,有详细解释),可以在数据库中下载基因组的GFF文件,筛选出你的基因注释信息

Sequence (FASTA):第一个框里存放基因的CDS序列,第二个框里存放基因的完整序列,可以在NCBI数据库下载,或者在基因组数据中搜索需要ID的序列

小编这里推荐BED格式数据,数据格式简单,可以在基因组GFF文件筛选基因的这些信息 ,可以看我们以前文章(如何下下载一个基因组)下载基因组GFF文件

dna的化学结构图,dna化学物质组成(3)

2.绘图及图片的修改和保存

选中一个数据类型,点击Example,就会显示一个该类型数据的例子,可以将自己的数据直接复制粘贴到下图框里,或者直接选择存放数据的文件导入数据。

dna的化学结构图,dna化学物质组成(4)

首页 1234下一页

栏目热文

文档排行

本站推荐

Copyright © 2018 - 2021 www.yd166.com., All Rights Reserved.