核武器
1945年7月16日，印第安纳波利斯号大修完毕之后，就接到了一项极其重要的绝密任务，秘密运送大量的浓缩铀以及机密零件到太平洋天宁岛的海军基地，这个绝密任务正好是美国“三位一体”核试验成功后数小时内下达的，（备注：“三位一体”是人类史上首次核试验的代号）。
这些浓缩铀和机密零件是用来组装代号为“小男孩”原子弹的，这是第二次世界大战时美国在日本广岛市投掷的首枚原子弹，（备注：“小男孩”原子弹，长3米，宽71厘米，重达4000千克，其携带了64千克的铀-235）
小男孩
由于此次行动的高度保密，再加上时间紧迫，为了不引起日军的注意，这次任务没有派护卫舰护航，当时舰长查尔斯·麦克维三世（Charles B. McVay III）接到的命令就是，以最快的速度送达“货物”，“货物”具体是什么船上没有一个人知道。
查尔斯·麦克维三世（Charles B. McVay III）
在没有护航的情况下，该舰就悄无声息的从旧金山的猎人角海军造船厂出发，昼夜航行，一路狂奔，4天后顺利抵达夏威夷，驶进珍珠港，在补给了燃料和军需品之后再度起航，终于在7月26日抵达天宁岛，当日夜看守的“绝密货物”被小心翼翼地运送上岸之后，所有人都松了一口气，日夜兼程连续航行10天，将近10000公里。
日夜兼程连续航行10天
圆满完成了运输原子弹零件的任务后，印第安纳波利斯号先被安置在关岛稍作停留，数日后又接到前往莱特岛（Leyte）的命令，船上所有士兵会在莱特岛接受训练，然后加入到由副海军上将杰西·奥尔登多夫（Jesse B. Oldendorf）领导的第95特遣队，为登陆日本做准备。
然而谁也没有想到，这次航行将是印第安纳波利斯号的“末日之行”
最后的行程
1945年7月29日夜晚，印第安纳波利斯号独自从关岛前往莱特岛，当时的日本海军已经被打的溃不成军，能用的潜艇和舰队非常少，更何况关岛附近的海域都属是于美军的一个大本营范围，相对比较安全，可凡事总有意外。
