但是，作为封建社会赋税制度的改革，摊丁入亩也有它的历史局限性。首先，这项改革是出自统治者增加税收、缓和社会矛盾的利益需求。其次，在摊丁入亩的过程中，原来的“田赋”大大增加，本质上和康熙的“永不加赋”相悖，有一定程度的欺骗性。最后，摊丁入亩并没有解决土地所有制的问题，地主还是地主，农民还是农民。农民为地主种地，地主为了获取最大价值，更大程度地剥削佃户，这种改革并不彻底。
但这些局限性，并不能否定“摊丁入亩”的历史贡献，总体来说，雍正推行“摊丁入亩”，彻底废除人头税的做法，是中国历史，乃至中国赋役史上的一次较大进步，影响深远。
本文参考资料：《清史稿》《清史论丛》《清世宗实录》《会典》《汉书》《淮南子》《汉仪注》等
